More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2202 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2683  NADPH dehydrogenase  52.24 
 
 		 782 aa  791    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292135 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3831  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  74.72 
 
 		 792 aa  1192    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.436537  normal  0.67524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1826  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  71.48 
 
 		 772 aa  1173    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.913059  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02007  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  74.49 
 
 		 785 aa  1187    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4014  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  65.15 
 
 		 774 aa  1065    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  69.91 
 
 		 790 aa  1150    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0307  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.84 
 
 		 790 aa  715    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5038  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  70.67 
 
 		 782 aa  1116    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  59.92 
 
 		 776 aa  954    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2184  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  88.56 
 
 		 789 aa  1416    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19674  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7168  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  69.4 
 
 		 790 aa  1138    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0297  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  52.92 
 
 		 752 aa  764    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0437387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0656  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  68.97 
 
 		 777 aa  1136    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.844921  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1323  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  58.34 
 
 		 764 aa  904    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4472  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  76.57 
 
 		 782 aa  1247    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155704  normal  0.267141 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3944  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  74.72 
 
 		 792 aa  1192    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.134026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0593  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  69.18 
 
 		 777 aa  1141    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2111  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  69.47 
 
 		 775 aa  1136    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.452402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1202  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.48 
 
 		 780 aa  765    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0282  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  70.42 
 
 		 790 aa  1144    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5087  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  58.17 
 
 		 761 aa  911    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.608301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2202  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  100 
 
 		 791 aa  1636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24917  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0827  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  57.63 
 
 		 771 aa  917    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.13916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2243  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.33 
 
 		 764 aa  923    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0946349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3180  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  65.95 
 
 		 778 aa  1049    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.344257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2274  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  60.91 
 
 		 771 aa  961    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2161  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53 
 
 		 784 aa  780    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2695  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  59.51 
 
 		 761 aa  927    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0527527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2872  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  62.45 
 
 		 804 aa  990    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.347054  normal  0.96919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3617  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  66.34 
 
 		 822 aa  1102    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.278037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5522  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  51.97 
 
 		 791 aa  777    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291941 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2577  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  50.85 
 
 		 355 aa  336  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00218003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0881  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  49.6 
 
 		 387 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427162  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0611  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.86 
 
 		 370 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.316093 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1866  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.55 
 
 		 358 aa  331  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0652  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  51.86 
 
 		 370 aa  331  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  51.55 
 
 		 358 aa  331  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0991  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.81 
 
 		 387 aa  327  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0239278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7562  NADPH dehydrogenase  48.71 
 
 		 370 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0702  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase protein  49.86 
 
 		 370 aa  321  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00458318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3318  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.04 
 
 		 356 aa  321  3e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1489  xenobiotic reductase, putative  47.71 
 
 		 368 aa  319  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1299  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48 
 
 		 368 aa  319  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3810  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.31 
 
 		 356 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1165  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.35 
 
 		 356 aa  318  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3946  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.11 
 
 		 361 aa  316  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.181914  normal  0.508638 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1919  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.73 
 
 		 356 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.957099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3342  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  47.85 
 
 		 370 aa  312  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5174  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.76 
 
 		 387 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3775  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.78 
 
 		 379 aa  310  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.797165  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1456  FMN oxidoreductase  49.28 
 
 		 354 aa  310  5e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1036  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.71 
 
 		 368 aa  310  8e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4317  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.05 
 
 		 371 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529311  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1371  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  47.58 
 
 		 365 aa  308  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33410  NADH:flavin oxidoreductase  47.62 
 
 		 359 aa  308  3e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.374092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2608  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.93 
 
 		 371 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1086  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46 
 
 		 368 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.607736 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2083  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.45 
 
 		 353 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4139  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.71 
 
 		 368 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46 
 
 		 368 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.139205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4243  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.71 
 
 		 368 aa  303  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2817  monooxygenase FAD-binding protein  42.24 
 
 		 712 aa  302  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.606317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3253  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.56 
 
 		 370 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0090  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.71 
 
 		 370 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.61 
 
 		 370 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1398  putative FMN oxidoreductase  45.3 
 
 		 368 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.61 
 
 		 370 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2178  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.19 
 
 		 354 aa  301  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39430  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.29 
 
 		 368 aa  301  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2134  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.17 
 
 		 353 aa  301  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000241293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0966  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.3 
 
 		 369 aa  300  6e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104436  normal  0.525672 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1577  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  47.43 
 
 		 370 aa  300  8e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0241871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4010  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.17 
 
 		 370 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0211  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.17 
 
 		 370 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2779  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.03 
 
 		 354 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.487113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4082  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.17 
 
 		 370 aa  299  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0063  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.56 
 
 		 370 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0072  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.99 
 
 		 370 aa  296  9e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4902  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.18 
 
 		 358 aa  296  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  39.95 
 
 		 377 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16260  putative FMN oxidoreductase  43.87 
 
 		 368 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3060  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.99 
 
 		 376 aa  295  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.455155  normal  0.826511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4859  putative NADH-depentdent flavin oxidoreductase  41.11 
 
 		 371 aa  295  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563143  normal  0.207444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.82 
 
 		 373 aa  294  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2205  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.24 
 
 		 372 aa  294  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.517852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0071  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.99 
 
 		 370 aa  294  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2248  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.78 
 
 		 372 aa  293  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.674578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2523  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.78 
 
 		 372 aa  293  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0620053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0567  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.3 
 
 		 360 aa  291  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2687  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.47 
 
 		 373 aa  291  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7390  xenobiotic reductase A  43.06 
 
 		 363 aa  291  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2405  xenobiotic reductase A  43.52 
 
 		 363 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1069  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.97 
 
 		 372 aa  290  8e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3927  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.26 
 
 		 370 aa  289  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0013465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0144  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.63 
 
 		 367 aa  290  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0005  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  45.26 
 
 		 370 aa  289  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1514  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.21 
 
 		 371 aa  290  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5918  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.3 
 
 		 352 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2113  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.72 
 
 		 370 aa  289  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.16 
 
 		 365 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>