More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0072 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  757    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0101  hypothetical protein  75.91 
 
 		 357 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218333  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  67.92 
 
 		 374 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  66.94 
 
 		 374 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  66.67 
 
 		 374 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  57.67 
 
 		 379 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  56.91 
 
 		 374 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  59.66 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  57.18 
 
 		 374 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  56.12 
 
 		 374 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  56.12 
 
 		 374 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0491  protein of unknown function DUF140  59.04 
 
 		 377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13825  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4225  ABC transporter inner membrane protein  57.98 
 
 		 377 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.220227 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  56.65 
 
 		 374 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0612  ABC transporter, permease protein  57.71 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0431  putative ABC transporter, permease protein  57.71 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.238842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0373  ABC transporter, permease protein  57.1 
 
 		 404 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  56.58 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0450  putative ABC transporter, permease protein  57.71 
 
 		 374 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1361  ABC transporter, permease protein  57.91 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0066  ABC transporter, permease protein  59.38 
 
 		 355 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0232  putative ABC transporter, permease protein  59.66 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3201  putative ABC transporter, permease protein  59.66 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  53.93 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  52.66 
 
 		 378 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  53.49 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  51.03 
 
 		 383 aa  363  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  54.74 
 
 		 376 aa  363  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  53.07 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  54.01 
 
 		 375 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  50.84 
 
 		 368 aa  350  3e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  53.15 
 
 		 376 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0250  hypothetical protein  56.04 
 
 		 372 aa  332  8e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0244  protein of unknown function DUF140  56.62 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0920  hypothetical protein  54.78 
 
 		 374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0174  ABC transporter, permease protein, putative  50.83 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2365  hypothetical protein  46.74 
 
 		 373 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00138547  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  43.4 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  43.4 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  45.66 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  36.46 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  37.23 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  37.23 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  42.03 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  42.03 
 
 		 369 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  42.03 
 
 		 369 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  33.79 
 
 		 377 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  36.26 
 
 		 365 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  35.06 
 
 		 372 aa  196  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  37.12 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  39.85 
 
 		 413 aa  194  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  33.23 
 
 		 367 aa  192  6e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  33.17 
 
 		 376 aa  192  7e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  32.18 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  34.77 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  38.58 
 
 		 364 aa  190  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  33.43 
 
 		 368 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  32.18 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  32.18 
 
 		 374 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  35.36 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  38.1 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  33.68 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  35.84 
 
 		 430 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  32.11 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  35.47 
 
 		 377 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  34.49 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  33.62 
 
 		 378 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  33.08 
 
 		 378 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  34.52 
 
 		 364 aa  176  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2004  hypothetical protein  33.6 
 
 		 384 aa  176  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  33.88 
 
 		 384 aa  175  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  33.42 
 
 		 385 aa  176  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  32.89 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  35.96 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  37.55 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  34.93 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  33.04 
 
 		 406 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  30.91 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  32.99 
 
 		 382 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  32.78 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  34.23 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  34.28 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  33.16 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  35.03 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  32.27 
 
 		 387 aa  167  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  37.86 
 
 		 375 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  35.11 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  34.36 
 
 		 381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  34.8 
 
 		 366 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  34.36 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2807  protein of unknown function DUF140  33.85 
 
 		 379 aa  166  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  35.51 
 
 		 382 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  32.42 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  32.23 
 
 		 384 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1893  ABC transporter membrane spanning protein  34.6 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.228416  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  32.53 
 
 		 371 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  39.15 
 
 		 377 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  31.68 
 
 		 377 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  35.08 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  36.15 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>