265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2899 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2899  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 529 aa  1051    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.920708  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0808  beta-lactamase domain-containing protein  37.64 
 
 		 519 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.276491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1136  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.52 
 
 		 520 aa  278  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1034  hypothetical protein  30.73 
 
 		 519 aa  222  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000166295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0266  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  29.03 
 
 		 522 aa  179  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0268  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase-like protein  28.5 
 
 		 522 aa  174  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0260  beta-lactamase domain-containing protein  24.53 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2421  beta-lactamase domain protein  26.39 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2046  hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily-like  25.1 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.419381  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3305  beta-lactamase domain protein  26.92 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2388  beta-lactamase domain-containing protein  27.11 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.801347  normal  0.0151024 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0859  beta-lactamase domain-containing protein  22.91 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0698444  normal  0.411442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3999  beta-lactamase domain-containing protein  26.82 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.818404  normal  0.115324 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0647  beta-lactamase domain protein  27.78 
 
 		 551 aa  80.5  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.730868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2169  hypothetical protein  25.15 
 
 		 561 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0021  beta-lactamase domain protein  21.43 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2191  beta-lactamase domain protein  25.19 
 
 		 595 aa  78.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0623  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.55 
 
 		 611 aa  77.8  0.0000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0867442  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12765  hypothetical protein  26.53 
 
 		 558 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.868415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  25.97 
 
 		 561 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1453  beta-lactamase domain-containing protein  23.45 
 
 		 563 aa  77  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  25.59 
 
 		 557 aa  77  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1455  beta-lactamase domain protein  22.97 
 
 		 563 aa  76.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000013396 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0950  putative metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  24.78 
 
 		 616 aa  76.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2888  beta-lactamase domain-containing protein  30.45 
 
 		 429 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06070  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  22.48 
 
 		 556 aa  75.5  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  22.14 
 
 		 561 aa  73.9  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1150  hypothetical protein  24.49 
 
 		 675 aa  73.6  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.920604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4720  beta-lactamase domain protein  26.88 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.209873 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3639  beta-lactamase domain-containing protein  27.42 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  22.67 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  22.48 
 
 		 561 aa  71.2  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4272  beta-lactamase domain-containing protein  24.78 
 
 		 568 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.49 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09390  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  26.27 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.293183  normal  0.492875 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  23.21 
 
 		 554 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1763  beta-lactamase domain protein  25.07 
 
 		 650 aa  70.1  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  25.3 
 
 		 561 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  35.11 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15520  beta-lactamase domain protein  20.47 
 
 		 556 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  23.57 
 
 		 556 aa  68.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  21.22 
 
 		 572 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1639  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  22.12 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000492712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  23.47 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  22.42 
 
 		 558 aa  68.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  21.29 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1348  beta-lactamase domain-containing protein  24.06 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0621121  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0063  beta-lactamase domain protein  22.06 
 
 		 664 aa  67.8  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1625  beta-lactamase domain protein  21.53 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000210591  hitchhiker  0.00000143957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2117  beta-lactamase-like protein  25 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2163  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.270544 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2104  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.739055  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2534  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  25.9 
 
 		 557 aa  67  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.316819  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25 
 
 		 561 aa  67  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  23.94 
 
 		 561 aa  67  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1194  beta-lactamase domain-containing protein  25.9 
 
 		 557 aa  67  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.496445  normal  0.175299 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  24.11 
 
 		 561 aa  67  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  22.91 
 
 		 553 aa  66.6  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  24.38 
 
 		 561 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1390  beta-lactamase domain-containing protein  23.77 
 
 		 562 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2316  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 		 561 aa  66.6  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.175765  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1636  beta-lactamase domain-containing protein  19.25 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_2719  predicted protein  23.97 
 
 		 413 aa  66.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127667  hitchhiker  0.00814758 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1988  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 557 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10660  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  24.49 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000341022  unclonable  0.00000000210768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3543  beta-lactamase-like  23.62 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132705  normal  0.131405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3943  beta-lactamase domain protein  25 
 
 		 566 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.142082  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0905  beta-lactamase domain-containing protein  19.25 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3309  beta-lactamase domain protein  25.07 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0174304  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29160  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  22.55 
 
 		 561 aa  64.7  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.813951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  21.17 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  22.75 
 
 		 569 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1041  beta-lactamase domain-containing protein  19.06 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.467823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0095  Beta-lactamase-like protein  24.81 
 
 		 550 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.560108  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0763  beta-lactamase-like  20.85 
 
 		 555 aa  63.9  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.614365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5806  beta-lactamase domain protein  24.63 
 
 		 559 aa  63.9  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0157  Beta-lactamase-like  20.83 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0259079  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  21.72 
 
 		 555 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl570  putative metallo-beta lactamase hydrolase  23.03 
 
 		 588 aa  63.2  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00258207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  23.89 
 
 		 561 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2228  beta-lactamase domain-containing protein  28.08 
 
 		 558 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.96004  normal  0.99136 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0793  putative RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.9 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.279593  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0306  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  22.02 
 
 		 635 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0684  hypothetical protein  22.49 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0817  metallo-beta-lactamase family protein  31.33 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0812  metallo-beta-lactamase family protein  31.33 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2150  beta-lactamase-like protein  24.92 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  21.11 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0096  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 		 550 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.458831 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07540  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  22.95 
 
 		 631 aa  61.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000160452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2408  beta-lactamase domain-containing protein  31.33 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1879  metallo-beta-lactamase family protein  21.2 
 
 		 662 aa  61.2  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3342  beta-lactamase domain protein  25.61 
 
 		 548 aa  61.2  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1037  beta-lactamase-like  32.84 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  21.5 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3001  beta-lactamase domain-containing protein  23.71 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1361  beta-lactamase domain-containing protein  26.32 
 
 		 574 aa  60.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2084  metallo-beta-lactamase family protein  21.2 
 
 		 662 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000702612  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  20.8 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>