More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1427 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  53.19 
 
 		 642 aa  682    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 663 aa  1350    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  53.43 
 
 		 641 aa  667    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7155  AMP-dependent synthetase and ligase  48.84 
 
 		 668 aa  631  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2566  putative acetoacetyl-CoA synthase  47.75 
 
 		 646 aa  625  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000120954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  47.75 
 
 		 646 aa  627  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2333  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  47.75 
 
 		 646 aa  625  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2292  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  47.75 
 
 		 646 aa  626  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365139  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  47.75 
 
 		 646 aa  626  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  47.91 
 
 		 646 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  47.99 
 
 		 646 aa  624  1e-177  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2376  acetoacetyl-CoA synthase  47.75 
 
 		 646 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.381353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  47.6 
 
 		 646 aa  622  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0926585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2553  acetoacetyl-CoA synthase  47.75 
 
 		 646 aa  624  1e-177  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2517  putative acetoacetyl-CoA synthase  48.14 
 
 		 646 aa  623  1e-177  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  45.69 
 
 		 674 aa  605  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  45.8 
 
 		 694 aa  605  9.999999999999999e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  46.13 
 
 		 670 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  46.78 
 
 		 663 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3467  AMP-dependent synthetase and ligase  50.46 
 
 		 670 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0166  AMP-dependent synthetase and ligase  48.61 
 
 		 623 aa  555  1e-156  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2788  AMP-dependent synthetase and ligase  44.15 
 
 		 608 aa  543  1e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  43.23 
 
 		 650 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  43.64 
 
 		 650 aa  512  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2113  AMP-dependent synthetase and ligase  44.29 
 
 		 643 aa  511  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7333  AMP-dependent synthetase and ligase  42.24 
 
 		 650 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  38.4 
 
 		 641 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  41.58 
 
 		 670 aa  492  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  41.91 
 
 		 608 aa  488  1e-136  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0200095  normal  0.25307 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  42.7 
 
 		 667 aa  485  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  42.1 
 
 		 666 aa  483  1e-135  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  42.83 
 
 		 638 aa  477  1e-133  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  42.69 
 
 		 639 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  41.15 
 
 		 666 aa  472  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  41.71 
 
 		 660 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1428  AMP-dependent synthetase and ligase  41.73 
 
 		 640 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922087  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6401  AMP-dependent synthetase and ligase  41.73 
 
 		 640 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  40.9 
 
 		 659 aa  473  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1821  AMP-dependent synthetase and ligase  41.09 
 
 		 652 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  41.67 
 
 		 644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  42.88 
 
 		 639 aa  472  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  42.61 
 
 		 668 aa  468  9.999999999999999e-131  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  41.9 
 
 		 656 aa  467  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  41.14 
 
 		 648 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  42.07 
 
 		 661 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  39.85 
 
 		 653 aa  463  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  41.64 
 
 		 652 aa  463  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  42.06 
 
 		 631 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  41.2 
 
 		 655 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  42.3 
 
 		 649 aa  462  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  40.48 
 
 		 666 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  41.2 
 
 		 655 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  42.61 
 
 		 670 aa  459  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  40 
 
 		 656 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  40.47 
 
 		 667 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  39.75 
 
 		 667 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  40.66 
 
 		 667 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  42.62 
 
 		 661 aa  457  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  41.15 
 
 		 631 aa  459  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  39.94 
 
 		 657 aa  457  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  39.08 
 
 		 664 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  38.93 
 
 		 664 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  39.08 
 
 		 660 aa  459  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  40.82 
 
 		 632 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2783  acetate/CoA ligase  43.51 
 
 		 651 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.943311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  40.66 
 
 		 632 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  40.8 
 
 		 658 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  40.34 
 
 		 649 aa  453  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  41.57 
 
 		 656 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  42.86 
 
 		 661 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  41.96 
 
 		 646 aa  450  1e-125  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  40.1 
 
 		 664 aa  450  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  41.75 
 
 		 715 aa  452  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  40.73 
 
 		 655 aa  450  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  39.26 
 
 		 636 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  38.81 
 
 		 655 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  39.55 
 
 		 666 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  37.38 
 
 		 658 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6450  AMP-dependent synthetase and ligase  39.91 
 
 		 650 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  hitchhiker  0.0000000000000110833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  39.9 
 
 		 655 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  40.49 
 
 		 657 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  40.65 
 
 		 655 aa  446  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  37.7 
 
 		 658 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  40.75 
 
 		 656 aa  448  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  38.79 
 
 		 638 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  40.77 
 
 		 661 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  41.32 
 
 		 658 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  40.85 
 
 		 663 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  40.67 
 
 		 656 aa  445  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  38.99 
 
 		 648 aa  442  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  39.33 
 
 		 664 aa  444  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  38.46 
 
 		 636 aa  445  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  40.32 
 
 		 663 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  43.47 
 
 		 659 aa  445  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2810  acetate/CoA ligase  41.63 
 
 		 674 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  41.04 
 
 		 644 aa  445  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0066  acetate--CoA ligase  40.55 
 
 		 632 aa  445  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  42.12 
 
 		 651 aa  445  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  40.87 
 
 		 661 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1975  acetate--CoA ligase  38.87 
 
 		 654 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>