53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0726 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0726  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 289 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 1061 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 366 aa  53.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 591 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 927 aa  52.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 466 aa  52.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.95 
 
 		 560 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.23 
 
 		 1979 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.24 
 
 		 573 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0354  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 684 aa  49.7  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.431996  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  24.18 
 
 		 955 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 750 aa  49.3  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.08 
 
 		 436 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  26.77 
 
 		 985 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 602 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 543 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 4079 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.7 
 
 		 1694 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.05 
 
 		 745 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 409 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 375 aa  46.2  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 329 aa  45.8  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 687 aa  45.8  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  25.79 
 
 		 391 aa  45.8  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 1276 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.16 
 
 		 725 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1517  hypothetical protein  42.22 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0196221  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1798  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.53381e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.96 
 
 		 397 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 465 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  24.75 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 594 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.53 
 
 		 887 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 448 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  28.87 
 
 		 743 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1192 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 3035 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 520 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.5 
 
 		 782 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 187 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 818 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0996  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 499 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0468556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 512 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0424  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.446862  normal  0.0100173 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 804 aa  42.7  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0533  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 418 aa  42.4  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00172679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  41.07 
 
 		 638 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.29 
 
 		 784 aa  42.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.62 
 
 		 2240 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2155  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 147 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000155032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  26.87 
 
 		 1056 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>