More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6612 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  100 
 
 
302 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  93.02 
 
 
302 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  79.07 
 
 
302 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  78.41 
 
 
301 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  78.74 
 
 
302 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  78.74 
 
 
301 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  77.89 
 
 
303 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0330  flagellin domain protein  77.56 
 
 
303 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  74.68 
 
 
311 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157058 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  55.11 
 
 
321 aa  318  7e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  52.47 
 
 
320 aa  308  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  50.93 
 
 
320 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0748  flagella associated protein  51.85 
 
 
320 aa  299  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  50.93 
 
 
320 aa  296  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0752  flaB  50.15 
 
 
320 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1104  flagellin  52.22 
 
 
311 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.830976  normal  0.575801 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2814  flagellin domain protein  46.58 
 
 
332 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0265  flagellin domain-containing protein  60.17 
 
 
395 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2555  flagellin domain protein  46.44 
 
 
332 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4201  flagellin domain-containing protein  49.69 
 
 
327 aa  242  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.65453  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  71.19 
 
 
395 aa  238  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0266  flagellin domain-containing protein  59.34 
 
 
395 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0288  flagellin-like  50.49 
 
 
289 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0287  flagellin-like  50.97 
 
 
293 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356859  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  44.55 
 
 
292 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1138  flagellin  41.8 
 
 
321 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0331  flagellin domain protein  41.8 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0363  flagellin domain protein  41.16 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0920574  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1147  flagellin family protein  48.2 
 
 
282 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2690  flagellin domain-containing protein  44.34 
 
 
328 aa  209  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.768338  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1040  flagellin-like  41.56 
 
 
292 aa  182  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0599642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3219  flagella associated protein  39.4 
 
 
319 aa  178  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  62.96 
 
 
389 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1038  flagellin-like  40.13 
 
 
282 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.10381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2974  flagellin-like  38.41 
 
 
282 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1039  flagellin-like  38.82 
 
 
281 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0579144 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5741  flagellin domain-containing protein  48.29 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3134  flagellin-like  38.19 
 
 
281 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0651  flagellin domain protein  50 
 
 
592 aa  156  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1961  flagellin domain-containing protein  34.87 
 
 
274 aa  156  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.494071  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5136  flagellin domain-containing protein  37.5 
 
 
461 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0578954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5137  flagellin domain-containing protein  49.69 
 
 
461 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0677  flagellin domain-containing protein  49.69 
 
 
585 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1257  flagellin domain-containing protein  33.55 
 
 
274 aa  149  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.795763  hitchhiker  0.000282514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1962  flagellin domain-containing protein  34.11 
 
 
275 aa  148  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272266  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2886  flagellin domain-containing protein  36.04 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.919361  normal  0.0484882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3937  flagellin domain-containing protein  47.93 
 
 
494 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0911529  decreased coverage  0.00880768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  34.22 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0349  flagellin domain-containing protein  32.07 
 
 
364 aa  146  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3646  flagellin domain-containing protein  35.08 
 
 
273 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.619307  normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1620  flagellin domain-containing protein  37.05 
 
 
284 aa  143  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3254  flagellin domain-containing protein  32.57 
 
 
277 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875793  normal  0.855196 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1052  flagellin family protein  40.96 
 
 
269 aa  142  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3361  flagellin  45.69 
 
 
516 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0069  flagellin domain-containing protein  35.39 
 
 
273 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1959  flagellin domain-containing protein  36.21 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4162  flagellin domain-containing protein  36.22 
 
 
281 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00770352  normal  0.325059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5135  flagellin domain-containing protein  46.63 
 
 
590 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3878  flagellin  36.22 
 
 
281 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466019  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2887  flagellin domain-containing protein  32.14 
 
 
272 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0771595  normal  0.0510481 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2876  flagellin-like  34.54 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4203  flagellin-like  44.23 
 
 
522 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.618409  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0242  flagellin domain protein  38.89 
 
 
582 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2286  flagellin domain-containing protein  30.92 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3439  flagellin domain protein  33.23 
 
 
327 aa  115  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1040  flagellin A  36.84 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1682  flagellin domain-containing protein  39.35 
 
 
389 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  28.06 
 
 
289 aa  89.7  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  27.78 
 
 
279 aa  86.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  26.71 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  26.71 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  27.12 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0108  flagellin domain-containing protein  30.69 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  27.5 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  26.47 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  26.8 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  26.47 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  26.33 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  31.91 
 
 
518 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  25.49 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0803  flagellin domain protein  27.04 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1477  flagellar filament core protein  24.92 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  25.91 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  25.48 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1582  flagellin  25.91 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000267264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1706  flagellin  25.91 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0636682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  26.67 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0151  flagellin D  27.69 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979093  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  27.12 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  23.26 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  23 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  27.19 
 
 
383 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0804  flagellin domain protein  26.38 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  25.08 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1475  flagellar filament core protein  24.1 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  25.16 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0113  flagellin domain protein  27.88 
 
 
277 aa  67  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.232529  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  25.81 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  29.27 
 
 
399 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  29.57 
 
 
519 aa  67  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>