30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4786 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  86.6 
 
 		 194 aa  321  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  29.24 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  32.39 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  31.94 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  31.55 
 
 		 183 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  29.45 
 
 		 187 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  24.75 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  26.9 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  29.63 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  29.56 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  26.32 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  26.44 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  29.14 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  25.39 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  28.9 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  28.48 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  28.42 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  32.5 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  26.55 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  27.1 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  34 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  26.63 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  33.71 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  31.13 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  26.54 
 
 		 163 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  31.78 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  30.56 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2686  hypothetical protein  27.72 
 
 		 174 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  30.58 
 
 		 137 aa  42  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>