267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3368 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3368  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 
375 aa  735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3110  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  86.67 
 
 
375 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4516  acyl-CoA dehydrogenase type 2  45.57 
 
 
395 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.130533 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6565  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  44.13 
 
 
405 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.191589  normal  0.316976 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6150  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  44.64 
 
 
405 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00426369  hitchhiker  0.00144914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0353  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  35.37 
 
 
401 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5185  acyl-CoA dehydrogenase family protein  35.4 
 
 
401 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34300  DszC family monooxygenase  36.94 
 
 
405 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.803163  normal  0.0145718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2915  hypothetical protein  36.94 
 
 
405 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.281087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0239  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34.47 
 
 
397 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3157  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.36 
 
 
407 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31490  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  36.44 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4989  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.64 
 
 
393 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2362  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.84 
 
 
399 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00266653  hitchhiker  0.00112869 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0247  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.04 
 
 
393 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0223  DszC family monooxygenase  33.24 
 
 
406 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00885592  hitchhiker  0.00679283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2053  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.28 
 
 
403 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0930  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.35 
 
 
404 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0316102  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2255  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.35 
 
 
400 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0238  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.24 
 
 
393 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.679999  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1015  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.35 
 
 
404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1544  hypothetical protein  35.97 
 
 
420 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.86549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2549  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.34 
 
 
434 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7712  Acyl-CoA dehydrogenase, central region  33.33 
 
 
425 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2550  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.51 
 
 
413 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405659  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43650  Acyl-CoA dehydrogenase  34.29 
 
 
414 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618443  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1147  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.07 
 
 
400 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1521  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.07 
 
 
404 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.954011  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0092  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.07 
 
 
404 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.362932  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5156  acyl-CoA dehydrogenase  35.38 
 
 
420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0718281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2985  acyl-CoA dehydrogenase family protein  34.04 
 
 
426 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2551  putative acyl-CoA dehydrogenase  35.86 
 
 
416 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.285917  normal  0.436959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5014  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.16 
 
 
415 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0240  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.84 
 
 
413 aa  180  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0239  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.74 
 
 
413 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0248  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.49 
 
 
413 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2934  hypothetical protein  34.45 
 
 
411 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34550  hypothetical protein  34.45 
 
 
411 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0698049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0224  DszC family monooxygenase  32.74 
 
 
413 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4988  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.49 
 
 
413 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2439  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.98 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0877  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.21 
 
 
429 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.485998  normal  0.261313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0554  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.38 
 
 
417 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2998  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.73 
 
 
410 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2916  hypothetical protein  33.25 
 
 
411 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5184  acyl-CoA dehydrogenase family protein  32.11 
 
 
440 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.995233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2755  hypothetical protein  32.72 
 
 
414 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34320  DszC family monooxygenase  32.73 
 
 
411 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.404084  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2254  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.12 
 
 
451 aa  169  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0928  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.12 
 
 
412 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0398526  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1742  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.77 
 
 
412 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.469598  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1903  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.08 
 
 
417 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2572  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.86 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275239 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1523  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.86 
 
 
412 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1148  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.86 
 
 
412 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1013  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.86 
 
 
412 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.153934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0091  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.86 
 
 
412 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6515  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like  31.47 
 
 
412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6749  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.47 
 
 
412 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6338  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.47 
 
 
412 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3100  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.16 
 
 
392 aa  166  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2009  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0963467  hitchhiker  0.00351271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.75 
 
 
413 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.478253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0354  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal  31.65 
 
 
440 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31480  Acyl-CoA dehydrogenase family protein  31.58 
 
 
424 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1545  hypothetical protein  32.63 
 
 
416 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828601  normal  0.5845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2440  acyl-CoA dehydrogenase family protein  30.75 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0806323  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2054  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.79 
 
 
415 aa  155  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.876427  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2677  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.68 
 
 
433 aa  153  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.3001  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1778  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.29 
 
 
425 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251662  normal  0.768767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1370  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.81 
 
 
395 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1779  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.54 
 
 
430 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.392008  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5155  acyl-CoA dehydrogenase  30.05 
 
 
422 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3957  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  34.68 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0790683  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7499  Acyl-CoA dehydrogenase  32.49 
 
 
412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140498  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3664  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.68 
 
 
419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.952309  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1581  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.7 
 
 
413 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2571  putative acyl-CoA dehydrogenase  31.48 
 
 
420 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4227  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.48 
 
 
418 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0340079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0889  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  32.81 
 
 
398 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0906  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.81 
 
 
398 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3951  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  33.51 
 
 
419 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.865313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0895  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.55 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0424541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4228  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.99 
 
 
412 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0024  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.6 
 
 
418 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.641341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2008  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.21 
 
 
425 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.200025  hitchhiker  0.00322208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2361  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.03 
 
 
412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00969514  hitchhiker  0.0011963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.61 
 
 
410 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6061  acyl-CoA dehydrogenase  29.43 
 
 
326 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1495  hypothetical protein  32.28 
 
 
403 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0879599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0104  putative acyl-CoA dehydrogenase  27.75 
 
 
412 aa  119  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2992  acyl-CoA dehydrogenase family protein  29.02 
 
 
412 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270684  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7082  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.97 
 
 
405 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.254723  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3488  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  28.68 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3501  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.68 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102842  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3551  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.68 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058709  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7189  acyl-CoA dehydrogenase  25.63 
 
 
412 aa  109  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2768  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.87 
 
 
407 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2667  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.53 
 
 
407 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2550  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.02 
 
 
416 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.815294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>