More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2493 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2493  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
255 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2195  adenylate/guanylate cyclase  92.94 
 
 
255 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5352  putative adenylate/guanylate cyclase  50 
 
 
245 aa  230  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.269203 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  38.01 
 
 
645 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  35.56 
 
 
670 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.08 
 
 
1050 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  37.08 
 
 
1050 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.59 
 
 
611 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  35.11 
 
 
518 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.21 
 
 
723 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.09 
 
 
764 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.85 
 
 
737 aa  94.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  34.21 
 
 
759 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.96 
 
 
1053 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  34.92 
 
 
614 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  33.9 
 
 
518 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  38.2 
 
 
320 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  38.2 
 
 
320 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.55 
 
 
723 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  34.29 
 
 
735 aa  92.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
822 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  32.95 
 
 
903 aa  92  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  31.91 
 
 
760 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
741 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.44 
 
 
1014 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
515 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  33.14 
 
 
1207 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  35.03 
 
 
665 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.57 
 
 
757 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  33.92 
 
 
725 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.15 
 
 
861 aa  89.4  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  31.84 
 
 
523 aa  89  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.9 
 
 
879 aa  89  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  36.13 
 
 
1020 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.46 
 
 
815 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  36.13 
 
 
969 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  34.25 
 
 
650 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  31.46 
 
 
860 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  33.88 
 
 
638 aa  86.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  30.86 
 
 
479 aa  86.7  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  37.58 
 
 
971 aa  86.3  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  32.37 
 
 
746 aa  86.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.48 
 
 
1226 aa  85.9  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.02 
 
 
662 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 
859 aa  85.9  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  30.66 
 
 
756 aa  85.9  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  38.41 
 
 
468 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  36.51 
 
 
1198 aa  85.9  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  29.28 
 
 
744 aa  85.5  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.61 
 
 
696 aa  85.1  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  31.46 
 
 
864 aa  85.1  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  29.45 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  32.28 
 
 
582 aa  84.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
794 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  30.51 
 
 
911 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 
1160 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  30.29 
 
 
1093 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.52 
 
 
1055 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  29.11 
 
 
513 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.75 
 
 
597 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.43 
 
 
656 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 
483 aa  84  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  34.27 
 
 
740 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  32.68 
 
 
758 aa  83.2  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  37.33 
 
 
981 aa  82.8  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.61 
 
 
858 aa  82.8  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  39.13 
 
 
585 aa  82.8  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  29.67 
 
 
460 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 
1123 aa  82.8  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.43 
 
 
753 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  30 
 
 
717 aa  82.4  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
817 aa  82.4  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  37.23 
 
 
731 aa  82  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2916  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.59 
 
 
575 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0753379  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.75 
 
 
575 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.1 
 
 
703 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.87 
 
 
725 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  32.68 
 
 
758 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  30.51 
 
 
701 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  31.69 
 
 
469 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  32.16 
 
 
729 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  31.82 
 
 
529 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  24.7 
 
 
1153 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  32.26 
 
 
483 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  35.2 
 
 
575 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  39.1 
 
 
645 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0506  adenylate/guanylate cyclase  37.57 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.149903  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  32.26 
 
 
483 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.85 
 
 
657 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  31.07 
 
 
465 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 
526 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  31.46 
 
 
1094 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 
462 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.67 
 
 
1141 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  34.03 
 
 
421 aa  79  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  29.71 
 
 
1139 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.45 
 
 
672 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 
1172 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  32.2 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 
738 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>