More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1954 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1954  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
303 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1777  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  85.43 
 
 
303 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  0.0243796 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2237  agmatinase  69.21 
 
 
303 aa  451  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1151  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  44.57 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1578  agmatinase  44.48 
 
 
318 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1957  arginase family protein  42.69 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1883  arginase family protein  42.8 
 
 
337 aa  225  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4509  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  40.22 
 
 
323 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3103  agmatinase  41.67 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0277  agmatinase  42.34 
 
 
322 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.17372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2290  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.8 
 
 
312 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  38.22 
 
 
305 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  36.94 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  36.24 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  35.87 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  34.38 
 
 
322 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  31.56 
 
 
315 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  28.73 
 
 
297 aa  105  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  32.06 
 
 
315 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0545  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.81 
 
 
332 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  35.75 
 
 
318 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  28.24 
 
 
396 aa  101  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  35.29 
 
 
318 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  33.77 
 
 
324 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  30.77 
 
 
315 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  30.31 
 
 
315 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  31.43 
 
 
318 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0557  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.17 
 
 
332 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.30365e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  31.1 
 
 
401 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  35.29 
 
 
342 aa  99.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  34.78 
 
 
317 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  34.84 
 
 
318 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  34.84 
 
 
318 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  32.57 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  35.29 
 
 
354 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  27.84 
 
 
396 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  35.29 
 
 
354 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  34.84 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  35.29 
 
 
329 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  33.49 
 
 
317 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  34.4 
 
 
317 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  34.4 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  34.4 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4055  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.2 
 
 
335 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  34.4 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  34.4 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  34.4 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  31.15 
 
 
319 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  29.92 
 
 
320 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  30.3 
 
 
316 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  29.92 
 
 
320 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1619  putative agmatinase  31.86 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  31.15 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6362  agmatinase  34.51 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.823573  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  29.92 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4292  agmatinase  35.62 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0488647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  28.1 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1784  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.93 
 
 
334 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0597  agmatinase, putative  30.65 
 
 
315 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  30.95 
 
 
285 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  31.92 
 
 
345 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  31.92 
 
 
345 aa  94  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2513  putative agmatinase  35.44 
 
 
290 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  29.79 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2118  agmatinase  31.61 
 
 
263 aa  93.2  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  29.79 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0384  agmatinase  30.91 
 
 
318 aa  92.8  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  29.79 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  29.79 
 
 
323 aa  92.8  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  31.54 
 
 
345 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  30.77 
 
 
323 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  30.77 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  30.33 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  35.68 
 
 
332 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2035  putative agmatinase  31.07 
 
 
324 aa  92  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.108559  normal  0.06349 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  26.57 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  26.57 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3924  agmatinase  34.7 
 
 
369 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0571349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  32.88 
 
 
318 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0721  putative agmatinase  35.43 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  28.45 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5705  agmatinase  33.63 
 
 
324 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  30.7 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  30.77 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  30.46 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4397  agmatinase  36.12 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal  0.976094 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  28.9 
 
 
288 aa  91.3  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  30.29 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  33.03 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  29.62 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  30.77 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  32.73 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  32.94 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  31.98 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1414  agmatinase  27.48 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000244509  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  32.57 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  30.34 
 
 
323 aa  89.7  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  30.42 
 
 
340 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  29.96 
 
 
293 aa  89.4  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>