More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6520 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6520  ABC transporter related  100 
 
 
276 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.510638 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6108  ABC transporter related  96.74 
 
 
276 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.665492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2499  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  84.7 
 
 
279 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1225  ABC transporter related  66.91 
 
 
274 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164506  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1591  ABC transporter related  68.4 
 
 
263 aa  367  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.963081  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4534  ABC transporter related  68.52 
 
 
263 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.94029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2185  ABC transporter related  67.54 
 
 
263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.839848  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2603  ABC transporter related  66.39 
 
 
256 aa  338  4e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00980266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0742  putative ABC transporter, ATP-binding protein  63.29 
 
 
257 aa  317  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267111  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3976  ABC transporter related  63.79 
 
 
257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1889  ABC transporter related  59.59 
 
 
257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.110075  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4240  ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 
260 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2397  ABC transporter related  54.68 
 
 
268 aa  290  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1341  ABC transporter-like  59.26 
 
 
262 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.359238  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1364  ABC transporter related  58.9 
 
 
289 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.245091  normal  0.0323343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2684  ABC transporter related protein  55.21 
 
 
263 aa  289  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3974  ABC transporter  59.26 
 
 
260 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.161065  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4452  ABC transporter related  56.15 
 
 
253 aa  286  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0610  ABC transporter related  58.12 
 
 
268 aa  281  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2358  ABC transporter related  60.34 
 
 
246 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.869822  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2730  ABC transporter related  64.22 
 
 
280 aa  277  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0048  ABC transporter related  53.16 
 
 
259 aa  271  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1124  ABC transporter  55.41 
 
 
267 aa  260  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3490  ABC transporter related  48.17 
 
 
303 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.5 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  43.81 
 
 
261 aa  178  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  43.32 
 
 
286 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  45.45 
 
 
251 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.23 
 
 
258 aa  176  5e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
333 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  42.72 
 
 
258 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41 
 
 
257 aa  175  8e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  42.13 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  42.52 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.86 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.53 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.86 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.07 
 
 
280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.06 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.55 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  43.58 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.01 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  44.25 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.6 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.08 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.19 
 
 
330 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.53 
 
 
254 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  43.96 
 
 
276 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0754  ABC transporter related  41.02 
 
 
363 aa  171  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  39.82 
 
 
254 aa  171  9e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
366 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  44.93 
 
 
284 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  43.27 
 
 
275 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 
333 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  43.44 
 
 
333 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  42.2 
 
 
245 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.56 
 
 
304 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
308 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  41.78 
 
 
271 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  42.25 
 
 
259 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  43.89 
 
 
333 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.24 
 
 
253 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  43.26 
 
 
387 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4456  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.98 
 
 
280 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.458938  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  43.56 
 
 
303 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4922  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.54 
 
 
286 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.659379  normal  0.550165 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3789  ABC transporter related  46.91 
 
 
281 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.860108  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  43.66 
 
 
323 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  43.56 
 
 
303 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4393  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.98 
 
 
280 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  43.56 
 
 
303 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  45.32 
 
 
293 aa  169  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.07 
 
 
337 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  45.13 
 
 
259 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  45.07 
 
 
527 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  46.98 
 
 
343 aa  168  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.72 
 
 
330 aa  168  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1647  ABC transporter related  44.29 
 
 
330 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480345  normal  0.121683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  43.78 
 
 
352 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.65 
 
 
375 aa  168  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.65 
 
 
375 aa  168  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  44.39 
 
 
259 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  44.14 
 
 
267 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  44.39 
 
 
244 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.24 
 
 
346 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
355 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0328  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  41.74 
 
 
267 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6092  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (polyamine)  41.4 
 
 
358 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  44.09 
 
 
276 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.5 
 
 
260 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 
252 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  39.3 
 
 
339 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  42.86 
 
 
351 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  44 
 
 
267 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 
332 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  44.44 
 
 
273 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  41.09 
 
 
304 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.28 
 
 
423 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>