22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6494 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  100 
 
 		 424 aa  842    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  91.04 
 
 		 424 aa  756    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  25.2 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  30.9 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  30.9 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0609  O-antigen polymerase  25.74 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  26.27 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1694  O-antigen polymerase  25.98 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000414796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  23.91 
 
 		 415 aa  50.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  24.65 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0083  O-antigen polymerase  24.24 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0973021  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2022  O-antigen polymerase  26.03 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  27.67 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  26.09 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4374  O-antigen polymerase  26.1 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  22.86 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  29.37 
 
 		 531 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0257  O-antigen polymerase  27.57 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>