48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3790 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4119  polysaccharide biosynthesis protein  92.57 
 
 
1103 aa  2000    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3790  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
1103 aa  2207    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.500629 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6018  hypothetical protein  43.53 
 
 
636 aa  455  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1472  hypothetical protein  43.57 
 
 
592 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  48.43 
 
 
506 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0189  putative esterase/lipase/thioesterase  31.02 
 
 
592 aa  219  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6289  hypothetical protein  29.3 
 
 
605 aa  191  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2038  putative esterase/lipase/thioesterase  30.97 
 
 
614 aa  190  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.70175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  27.04 
 
 
634 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  28.24 
 
 
509 aa  164  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3318  hypothetical protein  26.54 
 
 
595 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0332966  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4198  hypothetical protein  26.26 
 
 
595 aa  155  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.656536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3619  hypothetical protein  27.78 
 
 
618 aa  155  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4094  hypothetical protein  28.57 
 
 
618 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5845  hypothetical protein  28.01 
 
 
615 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2884  hypothetical protein  28.02 
 
 
658 aa  140  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0637  hypothetical protein  28.02 
 
 
658 aa  140  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2506  hypothetical protein  28.02 
 
 
658 aa  140  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.676854  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  26.26 
 
 
631 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1819  hypothetical protein  27.84 
 
 
618 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594817  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4405  hypothetical protein  27.27 
 
 
608 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.844738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1078  polysaccharide biosynthesis protein  28.46 
 
 
511 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0468263  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2201  hypothetical protein  28.14 
 
 
636 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.180524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0651  hypothetical protein  26.57 
 
 
662 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0814  hypothetical protein  27.17 
 
 
1533 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0527  hypothetical protein  26.48 
 
 
707 aa  124  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649324  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0173  hypothetical protein  22.54 
 
 
585 aa  111  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1585  hypothetical protein  27.52 
 
 
588 aa  99.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.101596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2872  hypothetical protein  25.62 
 
 
638 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1079  hypothetical protein  24.78 
 
 
596 aa  75.5  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2964  hypothetical protein  24.92 
 
 
638 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6299  hypothetical protein  26.03 
 
 
261 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3187  hypothetical protein  36.59 
 
 
272 aa  66.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625607  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
511 aa  61.6  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0170  hypothetical protein  20 
 
 
597 aa  57.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  30.56 
 
 
290 aa  54.3  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  23.21 
 
 
476 aa  52.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.14 
 
 
285 aa  52  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6298  amino acid adenylation domain protein  34.45 
 
 
893 aa  50.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0234  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
256 aa  49.3  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.104073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 
487 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1074  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 
476 aa  47.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0510405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  33.64 
 
 
302 aa  46.2  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0128  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.92 
 
 
304 aa  45.8  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4269  polysaccharide biosynthesis protein  30.46 
 
 
440 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2376  putative redox protein  26.45 
 
 
259 aa  45.8  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  30 
 
 
305 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1352  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 
424 aa  45.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>