More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2359 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 370 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  88.17 
 
 		 367 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  69.75 
 
 		 367 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  37.08 
 
 		 464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  33.59 
 
 		 447 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  33.59 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  32.89 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 		 399 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  33.85 
 
 		 421 aa  176  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  32.47 
 
 		 404 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  41.8 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  31.76 
 
 		 401 aa  169  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  32.99 
 
 		 407 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.49 
 
 		 465 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  33.67 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  35.96 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  31.85 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  31.81 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  34.16 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  31.84 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.5 
 
 		 411 aa  156  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  32.99 
 
 		 517 aa  156  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  33 
 
 		 411 aa  155  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  34.99 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  40.71 
 
 		 348 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  37.75 
 
 		 405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  41.36 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  36.65 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  37.25 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  29.4 
 
 		 424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  32.23 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  30.1 
 
 		 406 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  30.33 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  31.32 
 
 		 416 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  40.28 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  30.45 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  31.51 
 
 		 425 aa  126  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  32.22 
 
 		 424 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.22 
 
 		 466 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  34.84 
 
 		 641 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.85 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  32.59 
 
 		 636 aa  106  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  29.76 
 
 		 614 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  30.04 
 
 		 702 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  37.18 
 
 		 726 aa  103  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 		 641 aa  102  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  35.5 
 
 		 645 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  30.05 
 
 		 701 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.86 
 
 		 500 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  29.21 
 
 		 701 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.67 
 
 		 650 aa  100  4e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  35.19 
 
 		 724 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.76 
 
 		 652 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 		 651 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  37.95 
 
 		 699 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  28.43 
 
 		 911 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  34.07 
 
 		 681 aa  96.3  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  30.14 
 
 		 584 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  36.13 
 
 		 564 aa  95.9  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.39 
 
 		 735 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  28.15 
 
 		 483 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  28.87 
 
 		 483 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.21 
 
 		 584 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  30.89 
 
 		 903 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  31.5 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  35.11 
 
 		 571 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.1 
 
 		 861 aa  94  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  31.76 
 
 		 561 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.12 
 
 		 858 aa  93.6  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  32.27 
 
 		 437 aa  93.6  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  32.98 
 
 		 632 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  29.69 
 
 		 643 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  27.64 
 
 		 638 aa  93.6  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  28.02 
 
 		 358 aa  92.8  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  35.68 
 
 		 632 aa  92.8  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 		 713 aa  92.8  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  34.25 
 
 		 577 aa  92.8  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  29.88 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  29.72 
 
 		 431 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  31.02 
 
 		 479 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  37.75 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  34.5 
 
 		 464 aa  91.3  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  31.84 
 
 		 1172 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  39.74 
 
 		 558 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.88 
 
 		 696 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  32.6 
 
 		 859 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  34.17 
 
 		 667 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  33.74 
 
 		 746 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 		 741 aa  90.1  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  28.95 
 
 		 1133 aa  89.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.21 
 
 		 757 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.71 
 
 		 585 aa  89.7  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 		 860 aa  89.7  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5738  adenylate/guanylate cyclase  35.75 
 
 		 553 aa  89.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231489 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.26 
 
 		 607 aa  89  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 		 740 aa  89  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  32.82 
 
 		 675 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>