49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0779 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  347  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  88.95 
 
 
182 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  56.04 
 
 
182 aa  204  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  59.67 
 
 
187 aa  201  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  59.65 
 
 
187 aa  197  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  59.06 
 
 
255 aa  197  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  45.56 
 
 
185 aa  153  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  46.86 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  31.67 
 
 
187 aa  117  7e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  31.67 
 
 
187 aa  117  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  43.43 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  41.25 
 
 
196 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  32.92 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  38.51 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  32.16 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  32.1 
 
 
186 aa  79  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1810  hypothetical protein  34.91 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.557377  normal  0.404127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  27.68 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  27.32 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4326  hypothetical protein  29.28 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  26.63 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  30.91 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  30.41 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  27.87 
 
 
192 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  31.11 
 
 
203 aa  62.4  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  28.25 
 
 
185 aa  60.8  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  28.57 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  31.48 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  30.61 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  29.88 
 
 
205 aa  54.7  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  32.7 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  25.29 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2203  hypothetical protein  28.27 
 
 
184 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.42645  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12131  hypothetical protein  31.82 
 
 
169 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  33.81 
 
 
208 aa  51.2  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  20.47 
 
 
192 aa  50.8  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  31.87 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  26.7 
 
 
190 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  26.59 
 
 
195 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  30.3 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  30.3 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  24.19 
 
 
210 aa  47  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  31.91 
 
 
167 aa  45.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  32.62 
 
 
202 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  24.57 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2447  hypothetical protein  26.01 
 
 
193 aa  41.2  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632564  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  23.65 
 
 
185 aa  41.2  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  23.65 
 
 
185 aa  41.2  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>