More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2519 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2519  transposase  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0829328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3434  transposase IS116/IS110/IS902  72.58 
 
 		 341 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  59.15 
 
 		 338 aa  184  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1372  IS111A/IS1328/IS1533  71.77 
 
 		 341 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0161177 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2041  transposase IS116/IS110/IS902  71.77 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0114  IS110 family transposase  67.74 
 
 		 340 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.57339e-19  hitchhiker  1.5997e-89 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5572  transposase IS116/IS110/IS902  71.54 
 
 		 338 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0488  putative transposase IS116/IS110/IS902  69.35 
 
 		 341 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4956  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  68.55 
 
 		 341 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.440622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1138  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  59.15 
 
 		 338 aa  174  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1637  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  59.15 
 
 		 338 aa  174  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0006  ISShdy1, transposase  66.67 
 
 		 338 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0989062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  63.64 
 
 		 499 aa  161  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.5 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.33 
 
 		 344 aa  159  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  54.26 
 
 		 341 aa  151  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  53.49 
 
 		 341 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60.33 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.84 
 
 		 341 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.84 
 
 		 341 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.2 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.2 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.02 
 
 		 342 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  54.62 
 
 		 298 aa  141  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  55.46 
 
 		 343 aa  138  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.99 
 
 		 340 aa  138  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1280  rmpB-like protein  55.83 
 
 		 303 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3127  hypothetical protein  67.42 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4212  transposase  58.18 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  59.66 
 
 		 338 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.03 
 
 		 355 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1748  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.03 
 
 		 355 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.03 
 
 		 355 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  53.78 
 
 		 342 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  50.41 
 
 		 338 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  50.41 
 
 		 338 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  50.41 
 
 		 338 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  50.41 
 
 		 338 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  50.41 
 
 		 338 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  50.41 
 
 		 338 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8011  transposase protein  59.32 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0203844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  46.63 
 
 		 341 aa  131  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  52.94 
 
 		 342 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4485  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.37 
 
 		 356 aa  131  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.218146  hitchhiker  0.00890094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.26 
 
 		 350 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.26 
 
 		 350 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.26 
 
 		 350 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0384  putative transposase  50.37 
 
 		 365 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0381  putative transposase  50.37 
 
 		 365 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0804  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  50.76 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796908  hitchhiker  0.00222246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.26 
 
 		 350 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  56.14 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.26 
 
 		 350 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  54.39 
 
 		 343 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2845  transposase IS116/IS110/IS902  52.85 
 
 		 355 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.277268  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4712  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.15 
 
 		 356 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.401794  normal  0.40759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  47.06 
 
 		 343 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  47.06 
 
 		 343 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  46.22 
 
 		 343 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  47.06 
 
 		 343 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  47.06 
 
 		 343 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  47.06 
 
 		 343 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  47.06 
 
 		 343 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7431  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.76 
 
 		 338 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  51.24 
 
 		 338 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.84 
 
 		 340 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1212  transposase IS116/IS110/IS902  50.41 
 
 		 355 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4642  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.59 
 
 		 318 aa  121  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.882664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.41 
 
 		 338 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.41 
 
 		 338 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.41 
 
 		 338 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.41 
 
 		 338 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  46.67 
 
 		 338 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.9 
 
 		 348 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.74 
 
 		 341 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.17 
 
 		 346 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0643  ISAfe1, transposase  50.85 
 
 		 322 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0965  transposase IS116/IS110/IS902  42.42 
 
 		 346 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1574  transposase IS116/IS110/IS902  42.42 
 
 		 346 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  42.42 
 
 		 346 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  42.42 
 
 		 346 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2061  transposase IS116/IS110/IS902  42.42 
 
 		 346 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232183  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2092  transposase IS116/IS110/IS902  42.42 
 
 		 346 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3124  transposase IS116/IS110/IS902  42.42 
 
 		 346 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3160  transposase IS116/IS110/IS902  42.42 
 
 		 346 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3275  transposase IS116/IS110/IS902  42.42 
 
 		 346 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3642  transposase IS116/IS110/IS902  42.42 
 
 		 346 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404408  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4440  transposase IS116/IS110/IS902  42.42 
 
 		 346 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4622  transposase IS116/IS110/IS902  42.42 
 
 		 346 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  56.3 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.3 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  47.93 
 
 		 338 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  47.93 
 
 		 338 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  47.93 
 
 		 338 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  47.93 
 
 		 338 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4167  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.81 
 
 		 332 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1453  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.81 
 
 		 332 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.81 
 
 		 332 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4005  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.81 
 
 		 332 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1999  transposase IS116/IS110/IS902  45.31 
 
 		 342 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>