281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2086 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2086  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
274 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  36.33 
 
 
280 aa  168  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
785 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 
525 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
1435 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
1739 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 
1077 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
1268 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
1162 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3563  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.03489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.94 
 
 
2401 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  29.91 
 
 
1119 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
499 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
680 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
401 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  22.34 
 
 
1600 aa  62.4  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
1340 aa  61.6  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
841 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1711  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
337 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9788799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
1523 aa  60.1  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.21 
 
 
427 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
291 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
679 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3804  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
582 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
410 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
376 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  38.83 
 
 
616 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 
824 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  25.95 
 
 
723 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2508  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000796473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4180  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
506 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
994 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
1523 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  20.49 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
286 aa  55.8  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
303 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.31 
 
 
700 aa  55.5  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  24.23 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5193  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
356 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
722 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
892 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
430 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 
624 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
306 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  30.91 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3593  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
346 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00282179  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
415 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.91 
 
 
970 aa  53.9  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
329 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0919  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
355 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00244033  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
348 aa  53.9  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
322 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
286 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1887  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
353 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
330 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
308 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  31.53 
 
 
336 aa  53.1  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.53 
 
 
322 aa  52.8  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  22.75 
 
 
322 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 
369 aa  53.1  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
970 aa  52.8  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 
235 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
597 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0966  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
312 aa  52  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
232 aa  52.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
358 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.83 
 
 
309 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
344 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1497  glycosyltransferase  25.23 
 
 
304 aa  52  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.041756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02692  glycosyl transferase  27.27 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  29.41 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
352 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2865  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
345 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000384977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  27.36 
 
 
451 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
317 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
293 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
746 aa  50.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  20.43 
 
 
419 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
314 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  24.43 
 
 
314 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 
337 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
308 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4543  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
332 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.503703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 
557 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
315 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.63 
 
 
315 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
341 aa  49.3  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
455 aa  49.3  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
358 aa  49.3  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1395  glycosyltransferase  29.46 
 
 
300 aa  49.3  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.438596  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
632 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>