218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6173 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5522  Hydantoinase B/oxoprolinase  67.31 
 
 
776 aa  1130    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93174  normal  0.130662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1019  acetone carboxylase, alpha subunit  90.96 
 
 
774 aa  1499    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6173  acetone carboxylase, alpha subunit  100 
 
 
774 aa  1621    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3510  hydantoinase B/oxoprolinase  69.91 
 
 
776 aa  1150    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0356093  normal  0.481953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3604  hydantoinase B/oxoprolinase  70.7 
 
 
775 aa  1155    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.918377  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4106  acetone carboxylase subunit alpha (or Hydantoinase B/oxoprolinase)  93.93 
 
 
774 aa  1539    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20920  acetone carboxylase alpha subunit; AcxB  82.57 
 
 
770 aa  1336    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.608945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1030  acetone carboxylase, alpha subunit  67.94 
 
 
779 aa  1107    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127431  normal  0.789221 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4262  hydantoinase B/oxoprolinase  67.83 
 
 
771 aa  1125    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.463856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1777  hydantoinase B/oxoprolinase  46.63 
 
 
737 aa  691    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0942  hydantoinase B/oxoprolinase  76.36 
 
 
774 aa  1300    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6151  hydantoinase B/oxoprolinase  82.95 
 
 
774 aa  1379    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2092  hydantoinase B/oxoprolinase  46.08 
 
 
736 aa  687    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3470  Hydantoinase B/oxoprolinase  93.41 
 
 
774 aa  1536    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281023  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3716  hydantoinase B/oxoprolinase  38.07 
 
 
730 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.207387  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1448  acetone carboxylase alpha subunit  26.82 
 
 
768 aa  194  5e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.674033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1847  hydantoinase B/oxoprolinase  26.9 
 
 
686 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.889679  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1162  hydantoinase B/oxoprolinase  23.59 
 
 
758 aa  172  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4359  hydantoinase B/oxoprolinase  25.6 
 
 
758 aa  170  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1342  hydantoinase B/oxoprolinase  24.25 
 
 
772 aa  169  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1834  hydantoinase B/oxoprolinase  26.61 
 
 
752 aa  167  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3096  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.3 
 
 
775 aa  165  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16642  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2506  hydantoinase B/oxoprolinase  24.89 
 
 
774 aa  163  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.615482  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1152  hydantoinase B/oxoprolinase  24.82 
 
 
747 aa  161  5e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11380  acetophenone carboxylase  24.51 
 
 
758 aa  160  7e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.33 
 
 
657 aa  154  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2036  hydantoinase B/oxoprolinase  25.65 
 
 
600 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.524189  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4899  hydantoinase B/oxoprolinase  24.07 
 
 
770 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.313887  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2242  hydantoinase B/oxoprolinase  25.4 
 
 
743 aa  144  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1207  hydantoinase B/oxoprolinase  23.58 
 
 
748 aa  138  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215827  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.48 
 
 
681 aa  128  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.2 
 
 
583 aa  121  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  24.11 
 
 
578 aa  120  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5621  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.28 
 
 
708 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.99583 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5330  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.28 
 
 
708 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.65 
 
 
564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.42 
 
 
585 aa  114  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.91 
 
 
601 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.99 
 
 
577 aa  112  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.26 
 
 
580 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  24.32 
 
 
1362 aa  108  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  25.56 
 
 
566 aa  107  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.68 
 
 
562 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  24.18 
 
 
1355 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.88 
 
 
564 aa  106  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.44 
 
 
632 aa  105  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.44 
 
 
597 aa  103  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.87 
 
 
645 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.85 
 
 
521 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.83 
 
 
519 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4976  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.19 
 
 
1210 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1517  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.54 
 
 
1220 aa  100  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  24.56 
 
 
563 aa  100  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5242  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.29 
 
 
646 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.860523  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.11 
 
 
515 aa  99.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.8 
 
 
577 aa  99  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4027  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.2 
 
 
558 aa  97.8  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.96 
 
 
575 aa  98.2  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2859  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.86 
 
 
629 aa  97.4  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.92 
 
 
582 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1781  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.44 
 
 
1213 aa  95.5  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0522024  normal  0.0235598 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.92 
 
 
579 aa  95.1  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.31 
 
 
1258 aa  95.1  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.97 
 
 
561 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.71 
 
 
645 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  24.56 
 
 
674 aa  94.7  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.36 
 
 
541 aa  94.4  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29736  5-oxoprolinase  23.38 
 
 
1319 aa  93.6  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.434949  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2390  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.63 
 
 
1229 aa  93.2  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.87 
 
 
519 aa  92.8  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.76 
 
 
552 aa  92.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5341  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.75 
 
 
633 aa  91.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.58 
 
 
527 aa  90.9  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  22.22 
 
 
1209 aa  90.9  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6273  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.11 
 
 
634 aa  90.5  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0677788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1926  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.95 
 
 
515 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.65 
 
 
586 aa  90.1  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1953  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.95 
 
 
515 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20950  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  23.1 
 
 
647 aa  89  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0175  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.58 
 
 
628 aa  88.6  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  25.47 
 
 
624 aa  87.8  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.77 
 
 
531 aa  88.2  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.86 
 
 
556 aa  87.4  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.76 
 
 
513 aa  87  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0791  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.28 
 
 
670 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.549712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4225  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.09 
 
 
588 aa  87.4  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.237131  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.57 
 
 
514 aa  87  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  23.65 
 
 
574 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  23.51 
 
 
581 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.12 
 
 
587 aa  85.5  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1877  Hydantoinase B/oxoprolinase  23.51 
 
 
613 aa  85.5  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  24.12 
 
 
529 aa  85.1  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  21.75 
 
 
584 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.64 
 
 
616 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.08 
 
 
572 aa  84.7  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86944  5-oxoprolinase  22.92 
 
 
1322 aa  84.7  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1059  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.77 
 
 
599 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331843  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5219  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  23.29 
 
 
568 aa  84.3  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.667486  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  22.72 
 
 
581 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  22.45 
 
 
1206 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>