More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4993 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  100 
 
 
406 aa  781    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  69.25 
 
 
397 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  65.93 
 
 
405 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  54.31 
 
 
391 aa  365  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  53.16 
 
 
391 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  59.25 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  52.74 
 
 
416 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  53.16 
 
 
391 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  53.16 
 
 
391 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  53.95 
 
 
392 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  52.89 
 
 
391 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  54.72 
 
 
388 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  53.68 
 
 
388 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  55 
 
 
390 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  55 
 
 
390 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  55 
 
 
390 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  55 
 
 
390 aa  348  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  55 
 
 
390 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  54.72 
 
 
390 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  54.72 
 
 
390 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  55.83 
 
 
390 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  52.91 
 
 
391 aa  342  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  48.03 
 
 
392 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  47.7 
 
 
385 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  48.29 
 
 
389 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  48.29 
 
 
389 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  54.29 
 
 
393 aa  295  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  49.86 
 
 
384 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  47.77 
 
 
389 aa  293  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  49.15 
 
 
386 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  49.15 
 
 
386 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  49.15 
 
 
386 aa  291  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  47.77 
 
 
389 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  46.74 
 
 
396 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  51.11 
 
 
389 aa  289  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  50.56 
 
 
389 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  50.56 
 
 
389 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  50.56 
 
 
389 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  46.75 
 
 
391 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  50.56 
 
 
389 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  50.28 
 
 
389 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  50.28 
 
 
389 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  50.28 
 
 
389 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  49.16 
 
 
389 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  49.44 
 
 
389 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  44.33 
 
 
408 aa  286  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  47.35 
 
 
388 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  49.15 
 
 
385 aa  286  5.999999999999999e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 
391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  46.04 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  43.58 
 
 
393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  47.08 
 
 
388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  46.99 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  47.04 
 
 
391 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  48.59 
 
 
406 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  46.75 
 
 
406 aa  282  9e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  46.76 
 
 
391 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  48.65 
 
 
391 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  44.21 
 
 
395 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  44.21 
 
 
395 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  46.63 
 
 
404 aa  279  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  48.65 
 
 
391 aa  279  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.15 
 
 
388 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  48.68 
 
 
391 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  47.35 
 
 
388 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  47.55 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  43.22 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  46.8 
 
 
388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  43.22 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  40.87 
 
 
395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  47.3 
 
 
388 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  47.75 
 
 
388 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  46.44 
 
 
412 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  43.48 
 
 
391 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  42.97 
 
 
391 aa  272  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  43.22 
 
 
391 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  44.19 
 
 
393 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  43.7 
 
 
409 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  44.73 
 
 
400 aa  271  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  47.12 
 
 
395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5131  major facilitator transporter  44.96 
 
 
402 aa  269  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229934  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  45.13 
 
 
391 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  49.73 
 
 
408 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  45.03 
 
 
388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  42.86 
 
 
389 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  44.04 
 
 
400 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  48.86 
 
 
390 aa  266  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  45.76 
 
 
430 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  45.35 
 
 
400 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  43.9 
 
 
400 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  47.14 
 
 
401 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  43.78 
 
 
400 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  47.84 
 
 
408 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  43.56 
 
 
391 aa  263  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  43.72 
 
 
388 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  38.42 
 
 
415 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  47.4 
 
 
407 aa  262  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  43.64 
 
 
400 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  43.75 
 
 
400 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>