More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4313 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  100 
 
 		 431 aa  845    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  49.64 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  48.67 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  49.64 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  49.02 
 
 		 438 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3887  major facilitator transporter  50.6 
 
 		 432 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.218515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  50.36 
 
 		 432 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  44.08 
 
 		 444 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.47 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  42.56 
 
 		 448 aa  338  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  42.09 
 
 		 434 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4685  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0687  major facilitator superfamily permease  40.88 
 
 		 436 aa  279  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1970  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 441 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5586  major facilitator superfamily permease  37.29 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14863  normal  0.124854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 474 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  26.22 
 
 		 453 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 453 aa  132  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 425 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  26.01 
 
 		 436 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 436 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  27.15 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  24.16 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  23.99 
 
 		 458 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  25.36 
 
 		 428 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5135  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.79 
 
 		 448 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  25.12 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  25.12 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  25.19 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  25.12 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  25.12 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4602  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0544774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2092  membrane transport protein  23.46 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  22.8 
 
 		 458 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3034  major facilitator family transporter  25.18 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.883875  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3267  major facilitator family transporter  25.18 
 
 		 450 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1644  major facilitator family transporter  22.97 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0579  major facilitator family transporter  22.97 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.801725  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 449 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  25.73 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 436 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2955  major facilitator family transporter  24.52 
 
 		 450 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 457 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 450 aa  103  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3260  major facilitator family transporter  24.29 
 
 		 451 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.82 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  23.06 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0851  putative D-galactonate transporter  26.46 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.997536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  22.68 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0484  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.46 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1898  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.46 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0894  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.46 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0815494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0581  glucarate transporter  26.46 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3421  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229013  normal  0.137893 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1755  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.46 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0350233  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2209  anion:cation symporter (ACS) family protein  26.46 
 
 		 448 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  25.98 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.1 
 
 		 456 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  22.04 
 
 		 430 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  22.04 
 
 		 430 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>