More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3910 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  100 
 
 		 435 aa  874    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.29 
 
 		 441 aa  581  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2274  histidine kinase  67.21 
 
 		 440 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0463006  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.21 
 
 		 439 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0816  histidine kinase  64.78 
 
 		 443 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2085  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  59.76 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5703  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  58.82 
 
 		 435 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.123247  normal  0.334136 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.28 
 
 		 440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.28 
 
 		 440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  56.28 
 
 		 440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  58.12 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.24 
 
 		 442 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.81 
 
 		 428 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.931435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.38 
 
 		 440 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.44 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414185  normal  0.194942 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.34 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.48 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2007  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.21 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.02 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  55.24 
 
 		 440 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.02 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0993  two-component sensor  54.48 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4427  histidine kinase  48.69 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1244  histidine kinase  39.28 
 
 		 438 aa  250  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0432448  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 488 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.73 
 
 		 469 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0433366  normal  0.502899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 443 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2346  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 		 717 aa  215  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.596828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  43.91 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  48.07 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 485 aa  210  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 464 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 349 aa  206  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 535 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2424  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 493 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.444371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2472  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 		 469 aa  202  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 480 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2106  sensor protein  32.06 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0080  sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 425 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0579685  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2222  sensor histidine kinase  38.01 
 
 		 344 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3381  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2031  sensor histidine kinase  37.78 
 
 		 344 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.911629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2373  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.351814  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0473  osmolarity sensor protein EnvZ, putative  38.44 
 
 		 474 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.44 
 
 		 444 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.86 
 
 		 330 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 488 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0851  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 488 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2388  sensor histidine kinase  35.26 
 
 		 469 aa  193  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  41.13 
 
 		 425 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  32.88 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  40.82 
 
 		 276 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 493 aa  186  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2093  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 463 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186061  normal  0.978183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000106108  normal  0.933142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2146  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 476 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1112  sensor histidine kinase  40.49 
 
 		 483 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.60391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280279  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2512  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1291  sensor histidine kinase  40.14 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4653  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 446 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.724731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04422  two-component system sensor protein  36.9 
 
 		 499 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3325  sensor histidine kinase  37.86 
 
 		 358 aa  179  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.205515  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2226  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 468 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6217  putative two component sensor histidine kinase  31.53 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0286  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 455 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.502891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 475 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2271  histidine kinase  31.76 
 
 		 479 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1067  histidine kinase  37.66 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6168  histidine kinase  39.5 
 
 		 337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 		 438 aa  173  5.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1960  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 442 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2738  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 425 aa  172  9e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0327693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2618  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1736  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158259  normal  0.298794 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 		 454 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1479  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  40.54 
 
 		 270 aa  171  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1937  putative two-component sensor  33.11 
 
 		 482 aa  170  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 473 aa  170  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1385  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 462 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.465495  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 450 aa  169  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 468 aa  169  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 484 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1012  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 484 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>