More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2691 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2691  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
267 aa  530  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93602  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2811  uroporphyrin-III C-methyltransferase  82.38 
 
 
254 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.481066  normal  0.964939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2420  uroporphyrin-III C-methyltransferase  79.41 
 
 
269 aa  358  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2684  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.76 
 
 
269 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2224  uroporphyrin-III C-methyltransferase  76.35 
 
 
269 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.16 
 
 
273 aa  296  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5801  uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.75 
 
 
249 aa  292  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0785741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2230  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.98 
 
 
255 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572034  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1859  uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.34 
 
 
249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2470  uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.34 
 
 
249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0824  uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.9 
 
 
252 aa  288  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350857  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2475  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.93 
 
 
249 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2387  uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.73 
 
 
249 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3659  uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.52 
 
 
251 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0819  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.16 
 
 
257 aa  284  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731908  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.32 
 
 
249 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2343  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.29 
 
 
278 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.29 
 
 
257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.219078  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1171  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.29 
 
 
257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.187417  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1657  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.29 
 
 
257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255381  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1018  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.29 
 
 
257 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1011  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.29 
 
 
259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2942  uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.29 
 
 
259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0975  uroporphyrin-III C-methyltransferase  62.75 
 
 
251 aa  279  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0998  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.36 
 
 
267 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2789  uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.16 
 
 
240 aa  175  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  43.85 
 
 
464 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.44 
 
 
464 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  43.44 
 
 
464 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0322  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.1 
 
 
277 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41563  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.97 
 
 
245 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0110837  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0795  siroheme synthase (Includes: Uroporphyrin-III C-methyltransferase, Precorrin-2 dehydrogenase,Sirohydrochlorin ferrochelatase)  41.91 
 
 
275 aa  169  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3528  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.97 
 
 
245 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0179276  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3285  uroporphyrin-III C-methyltransferase  48.62 
 
 
261 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23340  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.11 
 
 
245 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00949185  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  40.89 
 
 
465 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  40.98 
 
 
465 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2090  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.44 
 
 
246 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505615  normal  0.0362421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3650  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.44 
 
 
246 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000265889  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.98 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1698  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  41.42 
 
 
458 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0715064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.68 
 
 
487 aa  166  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.63 
 
 
259 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.87 
 
 
463 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.87 
 
 
463 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.87 
 
 
463 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2098  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.57 
 
 
253 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00176224  decreased coverage  0.00158802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.87 
 
 
464 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.7 
 
 
464 aa  165  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1290  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.62 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  43.8 
 
 
477 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2725  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000809754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3126  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  40.08 
 
 
462 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2300  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.4 
 
 
253 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00412694  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  43.8 
 
 
478 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  42.8 
 
 
462 aa  162  4.0000000000000004e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  41.6 
 
 
481 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2093  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.98 
 
 
247 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0878943  normal  0.0902648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1778  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.77 
 
 
250 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0293205  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1899  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.32 
 
 
247 aa  162  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.106927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6982  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  42.11 
 
 
476 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0267  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
521 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1160  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.57 
 
 
473 aa  161  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.277445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  38.96 
 
 
283 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1942  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  42.15 
 
 
331 aa  159  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2965  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  45.23 
 
 
259 aa  159  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0260792  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1601  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.74 
 
 
246 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170962  hitchhiker  0.00445927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3751  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.4 
 
 
282 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1443  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.93 
 
 
276 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.41 
 
 
479 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1608  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.16 
 
 
246 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000713921  decreased coverage  0.000000000148067 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1104  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40 
 
 
275 aa  158  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217718  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.34 
 
 
475 aa  158  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3562  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.33 
 
 
478 aa  158  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1549  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.51 
 
 
258 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.8 
 
 
276 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.66 
 
 
269 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1587  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.67 
 
 
258 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2146  siroheme synthase  41.37 
 
 
485 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529421  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2151  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 
258 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.16 
 
 
276 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.32 
 
 
272 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.8 
 
 
281 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1335  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.26 
 
 
258 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1308  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.26 
 
 
258 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1309  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.67 
 
 
258 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.8 
 
 
281 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1445  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.26 
 
 
258 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.51628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.26 
 
 
258 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.58633e-17 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2492  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.42 
 
 
272 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.32 
 
 
510 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.25 
 
 
277 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.746626  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1668  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.7 
 
 
271 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.228653  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.8 
 
 
278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3532  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.69 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.42 
 
 
273 aa  155  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.16 
 
 
276 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3305  siroheme synthase  42.45 
 
 
472 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3437  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.45 
 
 
472 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>