65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3642 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3642  methyltransferase type 11  100 
 
 		 355 aa  734    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000500593  decreased coverage  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0492  Methyltransferase type 12  26.37 
 
 		 746 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  28.25 
 
 		 217 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 208 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2762  methyltransferase  28.57 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.35 
 
 		 224 aa  52.8  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 217 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4856  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 235 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2231  methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 214 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 234 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0321  methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  32 
 
 		 194 aa  48.1  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  28.57 
 
 		 200 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  32 
 
 		 194 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  39.22 
 
 		 241 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1967  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 205 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 239 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 208 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  27.62 
 
 		 213 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 268 aa  47.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1760  methyltransferase type 11  22.94 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0752059  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.19 
 
 		 232 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 275 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 305 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  30.19 
 
 		 208 aa  46.6  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1816 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  27.88 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 209 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2191  methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 226 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0789  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  30.65 
 
 		 621 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.22 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1711  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 208 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.248441 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  27.84 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 255 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.95 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  29.37 
 
 		 200 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1357  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  27.14 
 
 		 219 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2403  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 262 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 711 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  30 
 
 		 559 aa  43.5  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 243 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 2046 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 276 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  27.91 
 
 		 283 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  29 
 
 		 193 aa  42.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  31 
 
 		 194 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 208 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  23.49 
 
 		 1621 aa  42.7  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 301 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>