188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1104 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1104  trehalose-phosphatase protein  100 
 
 		 262 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.387228  normal  0.386003 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4231  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  75.1 
 
 		 266 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4341  trehalose-phosphatase  75.1 
 
 		 266 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.173439 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2815  trehalose-phosphatase  50.87 
 
 		 269 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2755  trehalose-phosphatase  50.87 
 
 		 250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1752  trehalose-phosphatase  50.43 
 
 		 269 aa  214  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.502389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2873  trehalose-phosphatase  50 
 
 		 269 aa  211  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0565  trehalose-phosphatase  50 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2443  trehalose-phosphatase  50 
 
 		 269 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0678  HAD family hydrolase  49.56 
 
 		 250 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1157  HAD family hydrolase  49.56 
 
 		 250 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1039  HAD family hydrolase  49.16 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1133  HAD family hydrolase  49.56 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1035  HAD family hydrolase  49.16 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2838  trehalose-phosphatase  49.57 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1766  trehalose-phosphatase  49.57 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.869594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4269  HAD family hydrolase  48.91 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.582596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42400  trehalose-phosphatase  48.71 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2148  HAD family hydrolase  46.35 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524754  normal  0.803634 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0858  HAD family hydrolase  44.68 
 
 		 249 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2881  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.26 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941751  normal  0.303485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1241  trehalose-phosphatase  44.68 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2634  trehalose-6-phosphate phosphatase  44.73 
 
 		 266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130078  hitchhiker  0.0000000000001334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01866  trehalose-6-phosphate phosphatase, biosynthetic  44.73 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1745  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  44.73 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01855  hypothetical protein  44.73 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1288  trehalose-6-phosphate phosphatase  44.73 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0241592  hitchhiker  0.000000179042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1737  trehalose-6-phosphate phosphatase  44.73 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.758934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1994  trehalose-6-phosphate phosphatase  44.73 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000553553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2129  trehalose-6-phosphate phosphatase  44.73 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000674264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1022  trehalose-6-phosphate phosphatase  46.93 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2084  trehalose-6-phosphate phosphatase  43.1 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000038729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2090  trehalose-6-phosphate phosphatase  42.8 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  4.88107e-23 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1192  trehalose-6-phosphate phosphatase  43.1 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0385868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1315  trehalose-6-phosphate phosphatase  43.1 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.89318e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2145  trehalose-6-phosphate phosphatase  42.67 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.55592e-22 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3915  HAD family hydrolase  44.92 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2473  trehalose-6-phosphate phosphatase  41.08 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0005  HAD family hydrolase  45.81 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0526  HAD family hydrolase  45.87 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0503  HAD family hydrolase  45.99 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.874755  normal  0.0247471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0519  trehalose-phosphatase  45.99 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0355  HAD family hydrolase  46.5 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1468  HAD family hydrolase  44.77 
 
 		 245 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0414  trehalose-phosphatase  44.35 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0371  Trehalose-6-phosphatase protein  42.5 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0987  trehalose-phosphatase  45.06 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1529  HAD family hydrolase  39.84 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3792  trehalose-phosphatase  44.49 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.299059  hitchhiker  0.000919174 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5910  HAD family hydrolase  41.38 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0200  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.13 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.673335 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2945  HAD family hydrolase  41.95 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.18018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4909  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.49 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.379995  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2609  HAD family hydrolase  42.55 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0949  putative trehalose-6-phosphate phosphatase  42.13 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1107  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.45 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.0523288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4400  HAD family hydrolase  41.49 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4863  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  41.08 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0256801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1976  HAD family hydrolase  39.08 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4210  HAD family hydrolase  42.15 
 
 		 245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.418439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04867  trehalose-phosphatase  41.28 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1019  HAD family hydrolase  44.94 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.07517  normal  0.48063 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0306  HAD family hydrolase  42.39 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2062  HAD family hydrolase  41.03 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20898  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3153  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.26 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2714  HAD family hydrolase  39 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0236  HAD family hydrolase  39.58 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5869  HAD family hydrolase  40.51 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0577  trehalose-phosphatase (trehalose 6-phosphate phosphatase) (TPP)  39.11 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.24 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0220  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  40.83 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6319  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.82 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.777067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4524  HAD family hydrolase  38.56 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1722  HAD family hydrolase  41.56 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5493  HAD family hydrolase  42.08 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.55 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1027  HAD family hydrolase  36.58 
 
 		 269 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.794711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0916  trehalose-6-phosphatase  35.63 
 
 		 268 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.184398  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1771  HAD family hydrolase  44.05 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.165933 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3026  trehalose-phosphatase  37.45 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3613  HAD family hydrolase  36.93 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.574242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1503  HAD family hydrolase  38.53 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3608  HAD family hydrolase  36.19 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3162  HAD family hydrolase  41.96 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.248638 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0981  trehalose-phosphatase  38.22 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.977565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1368  trehalose-phosphatase  36.93 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0060  HAD family hydrolase  38.86 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13408  trehalose 6-phosphate phosphatase otsB2  38.46 
 
 		 391 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  37.96 
 
 		 525 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2717  trehalose-phosphatase  39.64 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4989  HAD family hydrolase  35.09 
 
 		 1186 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.87 
 
 		 1314 aa  105  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1656  HAD family hydrolase  36.71 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.475488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  34.48 
 
 		 1215 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  34.48 
 
 		 1215 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4107  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 1225 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130759  normal  0.249958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  34.48 
 
 		 1215 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0866  HAD family hydrolase  37.56 
 
 		 236 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0810  HAD family hydrolase  37.44 
 
 		 274 aa  96.3  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1968  trehalose-phosphatase  34.27 
 
 		 788 aa  95.5  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>