274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1434 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1434  ISRSO10-transposase ORFA protein  100 
 
 		 122 aa  247  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00759092  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0461  ISRSO10-transposase ORFA protein  100 
 
 		 122 aa  247  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.708206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1831  ISRSO10-transposase ORFA protein  100 
 
 		 121 aa  245  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.099383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  95.9 
 
 		 122 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  87.6 
 
 		 121 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  87.6 
 
 		 121 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  87.6 
 
 		 121 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  87.6 
 
 		 121 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  87.6 
 
 		 121 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  87.6 
 
 		 121 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1791  transposase IS3/IS911 family protein  85.12 
 
 		 121 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  74.38 
 
 		 133 aa  190  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  74.38 
 
 		 133 aa  190  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  74.38 
 
 		 133 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  70.49 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  70.49 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  70.49 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  70.49 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  70.49 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  70.49 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  70.49 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  70.49 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  70.49 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  70.49 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  70.49 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  70.49 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  70.49 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3164  insertion sequence 2 OrfA protein  70.49 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.703755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3224  insertion sequence 2 OrfA protein  70.49 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  70.49 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  70.49 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  70.49 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  70.49 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2332  ISRSO10-transposase ORFA protein  98.86 
 
 		 88 aa  180  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  69.67 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2169  transposase  69.67 
 
 		 154 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.114608  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  68.6 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  68.6 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  68.6 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  68.6 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  68.6 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  67.77 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  67.77 
 
 		 133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  59.02 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3761  putative transposase  77.42 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.571323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3182  transposase IS3/IS911 family protein  55 
 
 		 125 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2406  transposase IS3/IS911  55 
 
 		 141 aa  130  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  55 
 
 		 135 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  55 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  54.17 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  54.17 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4642  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.882945  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4252  transposase IS3/IS911 family protein  80.26 
 
 		 85 aa  123  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2541  transposase IS3/IS911 family protein  55.1 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.901832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6413  transposase IS3/IS911 family protein  49.14 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0741  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.93863 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4142  hypothetical protein  41.38 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4392  transposase IS3/IS911 family protein  41.38 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5766  transposase IS3/IS911 family protein  43.33 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0716  transposase  71.19 
 
 		 61 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44110  Transposase IS3/IS911  71.7 
 
 		 68 aa  80.9  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2335  remnant of ISRSO10-transposase protein  86.05 
 
 		 51 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6488  transposase IS3/IS911 family protein  41.89 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.229641  normal  0.803733 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6511  transposase IS3/IS911 family protein  41.89 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0972019 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4820  transposase IS3/IS911 family protein  50.77 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3008  transposase IS3/IS911  39.47 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4815  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.290342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6320  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  52.63 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4339  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8374  transposase IS3/IS911 family protein  41.33 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  35.87 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  37.66 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  45.76 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0611  putative transposase  42.39 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6363  putative transposase  42.39 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4167  IS3 family transposase  50 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0827165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0433  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0349226 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0917  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.308887  normal  0.246469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1415  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1417  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1807  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3518  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.734603 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3717  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3720  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3761  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4303  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4310  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1472  transposase IS3/IS911 family protein  44.29 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0558  IS66 family Orf1  50 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.412766  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0524  IS66 family orf1 transposase  50 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0397  transposase IS3/IS911  42.86 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.541296  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5386  transposase IS3/IS911 family protein  36 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.946691 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4907  transposase IS3/IS911 family protein  39.02 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25470  transposase IS3/IS911  72.5 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  50 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  31.58 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  47.06 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0648  transposase IS3/IS911  50.98 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  42.31 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>