More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4139 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4139  partition parA like-protein  100 
 
 		 241 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71144  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3901  virC1 gene, ATPase  61.6 
 
 		 298 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.691953  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8771  chromosome partitioning ATPase  27.04 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  27.5 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  27.41 
 
 		 219 aa  62  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2890  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.37 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.274539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2630  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.13 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0704  chromosome partitioning protein  24.75 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1770  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.48 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0003  partition protein  25.49 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000179256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4472  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.88 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.0000000000116025  unclonable  2.19652e-22 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.09 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3896  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3783  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0208258  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0125  plasmid partition protein ParF  23.66 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.369409  normal  0.733147 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4551  hypothetical protein  26.61 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5819  plasmid partitioning ATPase  27.11 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4164  hypothetical protein  28.87 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0393565  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.53 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4303  chromosome partitioning protein  25.38 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.18 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  39.81 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  38.46 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.61 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.61 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.6 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9806  chromosome partitioning protein  26.36 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.87 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6380  hypothetical protein  28.23 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  38.37 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8214  putative crown gall tumor protein VirC1  28.16 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.144693  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5343  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.79 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.17 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.17 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.13 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.32 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.66 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  23 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.79 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.84 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.42 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4199  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.43 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000176763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.68 
 
 		 271 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.37 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.41 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  23.14 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  58.54 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  25.81 
 
 		 263 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.76 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1542  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.84 
 
 		 293 aa  52.4  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0463481  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.64 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.84 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.46 
 
 		 263 aa  52  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.33 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.1 
 
 		 268 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.09 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  31.11 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.89 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  36.89 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0411  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.89 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  36.89 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  29.37 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.89 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.09 
 
 		 254 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.787744  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  36.89 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.36 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4249  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.36 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  22.57 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  36.89 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.26 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3782  chromosome segregation ATPase  25.81 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000230675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.03 
 
 		 480 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.31 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  25.1 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.78 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  36.26 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.14 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.52 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.49 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.91 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  36.46 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  25.17 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0076  chromosome segregation ATPase  25.81 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.22 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.37688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.09 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  37.86 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  45.16 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 		 217 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.09 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  36.26 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  36.26 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.46 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  25.33 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2605  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  52.38 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  52.38 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  36.26 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>