212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2423 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2423  putative heat shock protein 15 (HSP15)  100 
 
 		 98 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00936684  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1087  RNA-binding S4 domain-containing protein  97.96 
 
 		 98 aa  190  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1559  RNA-binding S4 domain-containing protein  85.87 
 
 		 100 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.200208  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0574  RNA-binding S4  55.43 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000475662  unclonable  0.0000000209736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3310  RNA-binding S4  51.14 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000290008  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1697  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.41 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3377  RNA-binding S4  51.09 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000950352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3135  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.08 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2740  RNA-binding S4  51.69 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.944293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2293  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.94 
 
 		 109 aa  84  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0107303  normal  0.537391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1827  RNA-binding S4 domain-containing protein  59.26 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000868037  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1132  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.65 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0247911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3706  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.6 
 
 		 102 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.325898 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1720  RNA-binding S4 domain protein  49.4 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.485798  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1959  RNA-binding S4 domain protein  47.31 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0257024  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1704  S4 domain-containing protein  46.67 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000120647  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1769  S4 domain-containing protein  46.67 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00186229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4117  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0870  RNA-binding S4  45.16 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.774132  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0075  RNA-binding S4  48.81 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0548587  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2572  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.35 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000329633 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2419  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.51 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.676645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.88 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595425  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1639  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.99 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.290258 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1369  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.454269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2075  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2640  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.78 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4145  RNA-binding S4 domain protein  41.3 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00358157  normal  0.0781043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3089  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.5 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4593  heat shock protein 15  43.53 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0122  RNA-binding S4  45.05 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3816  RNA-binding S4 domain protein  42.39 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3114  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00552893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3778  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  45.88 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3872  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  45.88 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0313  RNA-binding S4 domain protein  45.88 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3696  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  45 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4705  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  45.88 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.39239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0313  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  45.88 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0933812 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3678  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  45.88 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479283 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3596  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  45.88 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2048  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3694  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  45 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3769  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  45 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1368  RNA-binding S4 domain protein  43.04 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3866  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  43.75 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3803  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  43.75 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0490537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3813  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  42.5 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0176  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.35 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.905823  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3976  heat shock protein 15  42.35 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3737  heat shock protein 15  42.35 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0549  RNA-binding S4  40.7 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213997  normal  0.0613086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2006  RNA-binding S4  42.68 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.654471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4903  RNA-binding S4 domain protein  44.83 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.793751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03252  ribosome-associated heat shock protein Hsp15  44.71 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3698  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.01 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03204  hypothetical protein  44.71 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4803  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.6 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0850807  decreased coverage  0.0000637783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2515  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.35 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1231  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.68 
 
 		 138 aa  66.6  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.301013 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0328  RNA-binding S4 domain protein  43.59 
 
 		 137 aa  67  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4856  RNA-binding S4 domain protein  45 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0730838  normal  0.183947 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0509  RNA-binding S4 protein  45.24 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.916368  normal  0.173554 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4393  RNA-binding S4 domain-containing protein  45 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.853125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0410  RNA-binding S4  40 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.553472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2640  RNA-binding S4  45.12 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.414836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0249  RNA-binding S4 domain protein  42.5 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3836  RNA-binding S4  44.32 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0776  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.36 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00252001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0103  RNA-binding S4 domain-containing protein  40 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2470  RNA-binding S4 domain protein  43.02 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2496  putative heat shock protein  46.91 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0546  RNA-binding S4  42.53 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.879286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2876  RNA-binding S4 domain protein  43.02 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0228  RNA-binding S4  43.75 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4071  RNA-binding S4 domain protein  39.29 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0263  RNA-binding S4  43.18 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2637  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.05 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0747  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.18 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.503491  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0119  RNA-binding S4  41.98 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0359647  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1002  RNA-binding S4  42.53 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0505  RNA-binding S4  40.96 
 
 		 91 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0154787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7545  hypothetical protein  49.3 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0095  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.46 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.273746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0491  RNA-binding S4 domain protein  41.86 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0665  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.18 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3894  RNA-binding S4 domain protein  39.29 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2308  hypothetical protein  41.46 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0950  heat shock RNA-binding protein  38.2 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0206  RNA-binding S4  42.5 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0016  RNA-binding S4  41.25 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4615  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.82 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1408  RNA-binding S4 domain protein  40.23 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2659  RNA-binding S4  41.3 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.793293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4360  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.76 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0167  heat shock protein 15  37.65 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0728996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0170  RNA-binding S4  40.7 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.787324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0330  RNA-binding S4 domain protein  43.02 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0641  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.86 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0784  RNA-binding S4  65.96 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000665287  normal  0.0698441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>