58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0363 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  99.14 
 
 		 232 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  80.52 
 
 		 234 aa  361  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  51.58 
 
 		 223 aa  208  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0605  thiamine pyrophosphokinase  53.52 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  42.25 
 
 		 231 aa  151  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  39.72 
 
 		 229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  24.27 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1897  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  26.83 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  24.1 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2564  hypothetical protein  25.13 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2418  hypothetical protein  25.13 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  22.12 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1253  thiamine pyrophosphokinase  22.01 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  24.47 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  25.26 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  28.85 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  24.73 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  21.67 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  24.04 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12109  predicted protein  30.29 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.197387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  26.83 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  24.04 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  26.84 
 
 		 216 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  24.39 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  24.09 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  22.07 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  30.57 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  29.51 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  25.39 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  25.68 
 
 		 454 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  22.54 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  25.91 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  27.03 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  22.04 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  29.51 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  26.87 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  27.46 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  30.6 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  24.88 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  22.7 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  22.17 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  26.84 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  26.79 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  22.17 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  26.84 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  26.84 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  22.17 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  22.17 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  23.6 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  22.17 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  21.7 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  22.17 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  22.83 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.52 
 
 		 373 aa  42  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  21.13 
 
 		 213 aa  42  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5423  predicted protein  24.88 
 
 		 226 aa  42  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  33.82 
 
 		 382 aa  41.6  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>