43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3774 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  79.28 
 
 		 534 aa  831    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  84.96 
 
 		 536 aa  884    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  72.73 
 
 		 546 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1061    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  52.88 
 
 		 506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  48.31 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  42.5 
 
 		 526 aa  355  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  44.99 
 
 		 510 aa  349  7e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  40.8 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  35.51 
 
 		 493 aa  258  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2129  hypothetical protein  30.92 
 
 		 498 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2400  hypothetical protein  30.17 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.330729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  30.99 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  32.03 
 
 		 363 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1186  hypothetical protein  27.75 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.710855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  30.43 
 
 		 876 aa  53.5  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  37.61 
 
 		 279 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  22.91 
 
 		 310 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  26.19 
 
 		 298 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  33.63 
 
 		 474 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  30.25 
 
 		 279 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  31.9 
 
 		 241 aa  47.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2765  peptidase S15  33.64 
 
 		 254 aa  47.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 279 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 277 aa  47.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  33.64 
 
 		 277 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  30.08 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 303 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  31.86 
 
 		 463 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  29.31 
 
 		 256 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  35.4 
 
 		 300 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  36.07 
 
 		 272 aa  45.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5514  ABC transporter related  25.81 
 
 		 968 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4389  hypothetical protein  32.73 
 
 		 255 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1727  dienelactone hydrolase  32.38 
 
 		 254 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0666  dienelactone hydrolase  26.92 
 
 		 284 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  42.22 
 
 		 449 aa  44.3  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  37.78 
 
 		 1010 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  30 
 
 		 498 aa  43.9  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  32.84 
 
 		 281 aa  43.9  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  31.62 
 
 		 279 aa  43.5  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  31.62 
 
 		 279 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  31.62 
 
 		 279 aa  43.5  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>