More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2200 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  93.98 
 
 		 216 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  84.72 
 
 		 216 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  84.85 
 
 		 219 aa  352  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  78.24 
 
 		 218 aa  350  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.74 
 
 		 222 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  60.66 
 
 		 224 aa  265  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  62.44 
 
 		 225 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  58.33 
 
 		 225 aa  257  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  59.62 
 
 		 221 aa  248  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.67 
 
 		 221 aa  244  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.21 
 
 		 221 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2436  putative glutathione S-transferase  52.48 
 
 		 209 aa  221  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117632  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.22 
 
 		 210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3114  glutathione S-transferase-like  50.74 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1863  glutathione S-transferase-like protein  47.74 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.69 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  38.19 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.82 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  34 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  35.9 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.39 
 
 		 222 aa  104  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  35.23 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  31.94 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  33.82 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3541  glutathione S-transferase  36.27 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.136471  normal  0.509105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.29 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  31.55 
 
 		 201 aa  98.2  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  30.23 
 
 		 205 aa  98.2  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  31.71 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  31.19 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0021  glutathione S-transferase-like protein  29.77 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 		 206 aa  95.9  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 		 207 aa  95.1  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  30.41 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.06 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  29.03 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0724  glutathione S-transferase-like  30.23 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  30.54 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0019  glutathione S-transferase-like  30.45 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0024  Glutathione S-transferase domain  30.23 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.28 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  30.73 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  31.25 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0273  putative glutathione S-transferase  30.41 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3957  glutathione S-transferase-like  27.7 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2631  glutathione S-transferase-like protein  30.24 
 
 		 208 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 205 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1302  glutathione S-transferase domain protein  29.41 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0568234  normal  0.0901172 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  31.53 
 
 		 208 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  32.12 
 
 		 210 aa  88.2  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1800  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.02 
 
 		 232 aa  88.6  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.89 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.12 
 
 		 210 aa  87.8  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0318  putative glutathione S-transferase III (GST-III)  29.09 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.894729  normal  0.561156 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1353  Glutathione S-transferase domain protein  31.4 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.959522  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.66 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7159  Glutathione S-transferase domain  30.32 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218915  normal  0.479865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.33 
 
 		 204 aa  85.9  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1922  Glutathione S-transferase domain protein  28.57 
 
 		 232 aa  85.1  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3593  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 		 221 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404871  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  32.07 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.68 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2474  glutathione S-transferase family protein  27.49 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  30.52 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1148  glutathione S-transferase-like  32.2 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.289477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2015  glutathione S-transferase-like  27.62 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  27.94 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5570  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.17 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  29.85 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  30.35 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0739  glutathione S-transferase-like protein  30.73 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000125702  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3744  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.17 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.66674  normal  0.0935446 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0794  Glutathione S-transferase domain  29.41 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.730011  normal  0.341274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3634  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.890005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0261  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.29 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0907  Glutathione S-transferase domain protein  30.84 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411393  normal  0.132395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0269  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.81 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0265  Glutathione S-transferase domain protein  29.47 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.850678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.78 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  27.78 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.78 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  29.22 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1385  glutathione S-transferase-like protein  27.67 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.742051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  29.85 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.16 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>