236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4914 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4914  Hsp33-like chaperonin  100 
 
 		 332 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.247513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0897  Hsp33-like chaperonin  81.68 
 
 		 337 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0785  Hsp33-like chaperonin  82.28 
 
 		 351 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.193852 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0224  Hsp33-like chaperonin  77.91 
 
 		 335 aa  518  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0761  Hsp33-like chaperonin  77.11 
 
 		 331 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.0192555 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0134  Hsp33-like chaperonin  76.95 
 
 		 334 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5257  Hsp33-like chaperonin  78.68 
 
 		 351 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1220  Hsp33-like chaperonin  62.06 
 
 		 344 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0152  Hsp33-like chaperonin  59.8 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.684271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2316  Hsp33-like chaperonin  58.54 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0588394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7455  Hsp33-like chaperonin  56.78 
 
 		 337 aa  352  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349949  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6534  Hsp33-like chaperonin  58.23 
 
 		 336 aa  351  8e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.213938  normal  0.375392 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1971  Hsp33-like chaperonin  57.45 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0467896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2285  Hsp33-like chaperonin  57.14 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0830  Hsp33-like chaperonin  56.39 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2009  Hsp33-like chaperonin  57.14 
 
 		 335 aa  347  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.729287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0303  Hsp33-like chaperonin  53.7 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.280526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0396  Hsp33-like chaperonin  54.34 
 
 		 342 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0177  Hsp33-like chaperonin  52.88 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0007  Hsp33-like chaperonin  53.55 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721022  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0187  Hsp33-like chaperonin  52.88 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0129  Hsp33-like chaperonin  51.13 
 
 		 330 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0404  Hsp33 protein  48.26 
 
 		 331 aa  295  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1292  Hsp33-like chaperonin  46.95 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.716702  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0478  chaperonin heat shock protein 33  50.53 
 
 		 291 aa  269  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0488  Hsp33-like chaperonin  44.23 
 
 		 309 aa  262  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1234  Hsp33-like chaperonin  43.29 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3487  33 kDa chaperonin  41.59 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0079  Hsp33 protein  40.99 
 
 		 333 aa  233  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2889  Hsp33 protein  40 
 
 		 325 aa  229  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2573  Hsp33 protein  40.31 
 
 		 341 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196428  normal  0.645596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1207  putative Hsp33 protein  38.53 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000175569  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3275  Hsp33 protein  39.81 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2645  Hsp33 protein  37.95 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673391  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2868  Hsp33 protein  38.23 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0353  Hsp33 protein  39.93 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.859315  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1407  Hsp33 protein  40.71 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.265499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3139  Hsp33 protein  38.82 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2162  Hsp33 protein  38.83 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1357  Hsp33 protein  41.75 
 
 		 281 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0367  Hsp33-like chaperonin  36.27 
 
 		 295 aa  165  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05430  Hsp33-like chaperonin  38.28 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.512374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4960  Hsp33-like chaperonin  34.73 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000909918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0238  chaperonin, 33 kDa  36.99 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0169  Hsp33-like chaperonin  36.9 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2927  Hsp33-like chaperonin  34.14 
 
 		 291 aa  159  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2658  Hsp33 protein  36.27 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113843  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0094  Hsp33 protein  32.35 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5937  Hsp33-like chaperonin  34.22 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0252  Hsp33-like chaperonin  33.55 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0158259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3814  Hsp33-like chaperonin  32.99 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03253  Hsp33-like chaperonin  32.13 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0312  Hsp33 protein  32.13 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3873  Hsp33-like chaperonin  32.13 
 
 		 294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3679  Hsp33-like chaperonin  32.13 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369906 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3597  Hsp33-like chaperonin  32.13 
 
 		 294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3622  Hsp33-like chaperonin  32.07 
 
 		 286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.158671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0267  Hsp33-like chaperonin  36.07 
 
 		 300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0312  Hsp33-like chaperonin  32.13 
 
 		 294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03205  hypothetical protein  32.13 
 
 		 292 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0248  Hsp33-like chaperonin  32.53 
 
 		 290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4706  Hsp33-like chaperonin  32.13 
 
 		 294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0277  Hsp33-like chaperonin  33.23 
 
 		 299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3779  Hsp33-like chaperonin  31.8 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2309  Hsp33-like chaperonin  32.43 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0267  Hsp33-like chaperonin  33.23 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4361  Hsp33-like chaperonin  33.56 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68610  Hsp33-like chaperonin  33.55 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001895  heat-shock chaperonin  32.54 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4737  Hsp33-like chaperonin  33.22 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0669249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0118  Hsp33-like chaperonin  32.3 
 
 		 288 aa  150  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00598  Hsp33-like chaperonin  33.33 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4616  Hsp33-like chaperonin  32.64 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3867  Hsp33-like chaperonin  31.27 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0163  Hsp33-like chaperonin  33.33 
 
 		 286 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0327  Hsp33-like chaperonin  29.61 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0227  Hsp33-like chaperonin  31.33 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0153  Hsp33-like chaperonin  33.68 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0148  Hsp33-like chaperonin  33.68 
 
 		 286 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0141  Hsp33-like chaperonin  31.19 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0102  Hsp33-like chaperonin  30.24 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.293086  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4594  Hsp33-like chaperonin  32.4 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3570  Hsp33-like chaperonin  32.65 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.47947  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3697  Hsp33-like chaperonin  30.82 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0148  Hsp33-like chaperonin  33.33 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.896821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3770  Hsp33-like chaperonin  30.94 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2980  chaperonin HSP33  32.45 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2733  hypothetical protein  30.14 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3695  Hsp33-like chaperonin  30.94 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3895  Hsp33-like chaperonin  29.9 
 
 		 289 aa  143  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3804  Hsp33-like chaperonin  30.94 
 
 		 294 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1463  33 kDa chaperonin  32.4 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1687  chaperonin HSP33  32.4 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2708  chaperonin HSP33  32.4 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2628  chaperonin, 33 kDa  32.4 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2574  chaperonin, 33 kDa  32.4 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2190  chaperonin HSP33  32.4 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3128  chaperonin HSP33  32.4 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.206679  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0150  Hsp33-like chaperonin  31.96 
 
 		 286 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4209  Hsp33-like chaperonin  31.96 
 
 		 286 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>