254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4908 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  92.38 
 
 		 210 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  82.38 
 
 		 210 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  68.33 
 
 		 211 aa  254  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  66.11 
 
 		 210 aa  247  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  65.56 
 
 		 211 aa  245  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  57 
 
 		 209 aa  239  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  51.21 
 
 		 211 aa  201  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  50.57 
 
 		 226 aa  188  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  47.53 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  47.34 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  45.56 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  45.34 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  44.25 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  42.71 
 
 		 211 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  45.06 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  44.05 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  39.51 
 
 		 204 aa  147  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  39.51 
 
 		 204 aa  147  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  41.52 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  37.56 
 
 		 204 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  36.9 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  36.9 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.75 
 
 		 253 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  37.96 
 
 		 261 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  37.96 
 
 		 261 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  34.44 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  34.44 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  35.4 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 259 aa  101  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  35.63 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 255 aa  98.2  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 		 260 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  34.16 
 
 		 257 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 		 266 aa  95.9  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 		 255 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 		 263 aa  95.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  32.76 
 
 		 255 aa  95.1  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 254 aa  94  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  32.37 
 
 		 265 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  32.37 
 
 		 265 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  33.14 
 
 		 254 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 254 aa  92.8  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 		 238 aa  90.5  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  33.97 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  27.59 
 
 		 246 aa  89.7  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  30.56 
 
 		 274 aa  88.6  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  28.27 
 
 		 247 aa  88.2  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 		 252 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  32.76 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 		 252 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  27.75 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 268 aa  86.3  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 255 aa  85.9  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 		 247 aa  85.9  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  30.33 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  29.19 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  28.02 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  27.47 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  28.02 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  28.02 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.3 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  28.02 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  31.68 
 
 		 348 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 		 269 aa  78.2  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  28.26 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 		 535 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  31.55 
 
 		 671 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 281 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 		 671 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 		 671 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  26.95 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  31.95 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 664 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  22.67 
 
 		 265 aa  72  0.000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  29.26 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>