178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1862 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1862  thioesterase  100 
 
 		 260 aa  517  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3974  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.6 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3990  thioesterase  36.97 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4730  thioesterase  36.51 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198007  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.84 
 
 		 1337 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0169  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.18 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3018  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.66 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3104  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.66 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00747049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6554  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.61 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128368  hitchhiker  0.0000144099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2678  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  40.08 
 
 		 274 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2593  Thioesterase  42.22 
 
 		 264 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25620  Thioesterase  39.17 
 
 		 248 aa  148  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1890  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  42.92 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00202139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3728  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  34.55 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110395  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6482  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  39.91 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.630151  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2412  thioesterase  37.97 
 
 		 257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0301404  normal  0.200236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1269  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  36.44 
 
 		 256 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18470  predicted thioesterase involved in non-ribosomal peptide biosynthesis  40.95 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34840  putative non-ribosomal peptide synthetase  37.96 
 
 		 2125 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1885  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.69 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0672  Thioesterase  31.86 
 
 		 235 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3969  Thioesterase  36.17 
 
 		 246 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3448  Thioesterase  38.62 
 
 		 264 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3807  thioesterase  37.99 
 
 		 239 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.39937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  32.52 
 
 		 1354 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2417  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.25 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1962  thioesterase  37.99 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0483374  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0568  BarC  38.75 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2763  thioesterase  35.37 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381973 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1605  oleoyl-(acyl-carrier protein) hydrolase  37.04 
 
 		 271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.989365  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4034  thioesterase  39.65 
 
 		 251 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0892  BarC  39.17 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2592  thioesterase  39.17 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2456  putative thioesterase  39.17 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3488  thioesterase  39.21 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2109  thioesterase  38.5 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1343  thioesterase  33.78 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0278574 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0565  BarC  37.72 
 
 		 260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1033  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.84 
 
 		 291 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00721787  normal  0.0207581 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0895  BarC  38.16 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2595  thioesterase domain-containing protein  37.66 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2459  putative thioesterase  37.66 
 
 		 265 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  33.74 
 
 		 261 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1005  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.42 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1603  thioesterase  39.37 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.422548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1844  thioesterase  38.5 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.318802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2084  thioesterase  36.16 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4003  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  38.79 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.447201  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1679  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.98 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2122  linear gramicidin dehydrogenase LgrE  36.44 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0133  putative thioesterase  38.18 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1240  thioesterase II  38.64 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2357  thioesterase type II  35.98 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0189472  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1642  thioesterase domain-containing protein  38.18 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1561  thioesterase domain-containing protein  38.18 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1097  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  34.45 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0239  thioesterase  34.67 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33520  putative thioesterase  37.29 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0431986  normal  0.0271616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1944  thioesterase  35.27 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1713  thioesterase  28.95 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4057  Thioesterase  34.44 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2817  thioesterase  37.7 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1970  putative thiesterase family protein  35.37 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09230  pyochelin biosynthetic protein PchC  38.6 
 
 		 251 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.123608  normal  0.820972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2134  pyoverdine synthetase, thioesterase component  34.38 
 
 		 248 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.677253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0871  pyochelin biosynthetic protein PchC  38.6 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2848  putative thioesterase  36.86 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3033  thioesterase  31.97 
 
 		 829 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.862159  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54910  putative thioesterase  35.34 
 
 		 271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4321  Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  37.38 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2428  thioesterase  37.29 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79067  hitchhiker  0.00311284 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5826  thioesterase  36.7 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0496387  normal  0.387384 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1761  Thioesterase  30.43 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2465  thioesterase  28.26 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  33.2 
 
 		 832 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6056  thioesterase  36.24 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3770  pyochelin biosynthetic protein PchC  36.36 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.99771  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1959  thioesterase  38.74 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5540  thioesterase  31.33 
 
 		 249 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4323  Thioesterase  36.69 
 
 		 249 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1779  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  30.36 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0140397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7009  Thioesterase  33.04 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2456  thioesterase  34.65 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.317194  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1758  Thioesterase  35.48 
 
 		 261 aa  111  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  hitchhiker  0.00873666 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1333  Thioesterase  31.95 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1276  thioesterase  30.33 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5615  oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  25.76 
 
 		 240 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3475  Thioesterase  34.43 
 
 		 269 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.449577  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12408  phenyloxazoline synthase mbtB  31.56 
 
 		 1414 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3421  Thioesterase  31.11 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00113491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2871  thioesterase  26.67 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4690  CFA synthetase, thioesterase component  33.2 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5193  Thioesterase  30.64 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  normal  0.0757943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2828  thioesterase  34.2 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2584  thioesterase  27.2 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.354797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4712  coronamic acid synthetase, thioesterase component  31.43 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4759  thioesterase  33.05 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0669  thioesterase  31.3 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.628794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0025  type II thioesterase, CesT  32.41 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0630  Thioesterase  31.15 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>