131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1826 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1826  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1327  hypothetical protein  36.64 
 
 		 252 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1108  methyltransferase  37.5 
 
 		 255 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.18425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1102  methyltransferase  37.07 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1128  hypothetical protein  37.07 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1220  hypothetical protein  37.07 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1289  hypothetical protein  37.07 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.471005 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1365  hypothetical protein  36.64 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1115  methyltransferase type 11  34.63 
 
 		 252 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11528  methyltransferase  40.1 
 
 		 205 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.084318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1260  methyltransferase  36.15 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4081  methyltransferase  33.91 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0929  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3433  methyltransferase type 11  38.66 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1490  methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0869674  normal  0.806662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1357  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4709  methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 281 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.34266  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6864  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1480  methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 614 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3050  methyltransferase type 11  33.5 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0898  hypothetical protein  31.49 
 
 		 303 aa  109  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.816499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4233  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 293 aa  92  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102718  normal  0.351473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 2046 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1827  hypothetical protein  30.3 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580816  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  35 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2749  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2745  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 482 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.8 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  30.66 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0260  hypothetical protein  30.66 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  30.66 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  30.77 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.03 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3816  methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.552016  normal  0.740523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.6 
 
 		 268 aa  52.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 239 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 239 aa  52.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2928  hypothetical protein  30.61 
 
 		 224 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263693  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  25.95 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0101  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  35 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  25.71 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 251 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  31.47 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0254  methyltransferase type 12  28.29 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 274 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  27.09 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 733 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0305  hypothetical protein  53.66 
 
 		 196 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  31.06 
 
 		 251 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  30.07 
 
 		 244 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1767  phytanoyl-CoA dioxygenase  55 
 
 		 350 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2379  phytanoyl-CoA dioxygenase  55 
 
 		 350 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  54.05 
 
 		 461 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0299  hypothetical protein  51.06 
 
 		 171 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3043  hypothetical protein  45.1 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000591502  hitchhiker  0.0000218626 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.4 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6182  hypothetical protein  32.23 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.97 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  29.17 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30 
 
 		 277 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1361  methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 854 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  30.71 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  24.5 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  28.33 
 
 		 849 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  60.61 
 
 		 2796 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.27 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3797  hypothetical protein  30.34 
 
 		 350 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05015  hypothetical protein  29.66 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.2 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.32 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  29.33 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  26.18 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.23 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16171  hypothetical protein  30.47 
 
 		 287 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 624 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 2490 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1719  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 262 aa  45.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 263 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0744  Methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  25.16 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  51.52 
 
 		 828 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  60.61 
 
 		 668 aa  45.8  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  38.67 
 
 		 190 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71233  predicted protein  29.17 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.532537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  52.94 
 
 		 1476 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  28.29 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2638  methyltransferase type 12  28.68 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00142392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>