72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1010 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 		 176 aa  356  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  80.11 
 
 		 273 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  72.73 
 
 		 273 aa  269  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  72.16 
 
 		 273 aa  263  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  68.21 
 
 		 267 aa  234  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  55.11 
 
 		 264 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  58 
 
 		 277 aa  179  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  52.07 
 
 		 282 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  50.6 
 
 		 284 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  49.1 
 
 		 284 aa  148  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  50 
 
 		 270 aa  145  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  47.62 
 
 		 287 aa  141  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  46.99 
 
 		 271 aa  140  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  43.64 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  43.71 
 
 		 276 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  44.58 
 
 		 272 aa  134  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  44.58 
 
 		 271 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  42.01 
 
 		 271 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  43.56 
 
 		 280 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  46.78 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 267 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  42.6 
 
 		 271 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  42.46 
 
 		 271 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  42.55 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 255 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  34.97 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  32.41 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  32.41 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  32.41 
 
 		 390 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 		 279 aa  75.1  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  31.94 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 		 270 aa  72  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  33.12 
 
 		 270 aa  72  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 280 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 285 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 288 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  36.76 
 
 		 301 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  38.52 
 
 		 296 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.26 
 
 		 294 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 363 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 		 284 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 296 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 282 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0351  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 265 aa  48.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 282 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  36.54 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 		 285 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  30.57 
 
 		 293 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  34 
 
 		 281 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 298 aa  44.3  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  32.71 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  28.47 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  34 
 
 		 272 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  37.78 
 
 		 270 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 		 270 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 312 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0741  hypothetical protein  40 
 
 		 292 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 308 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 317 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 282 aa  41.6  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 302 aa  41.2  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 311 aa  41.2  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 351 aa  40.8  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>