125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0671 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0671  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 308 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4238  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 		 330 aa  165  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0107  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.2 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0097  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.2 
 
 		 351 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0289  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  35.05 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  34.45 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 		 302 aa  126  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2973  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3221  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.452086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  32.25 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 		 305 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4592  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1352  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  31.66 
 
 		 338 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5926  succinoglycan biosynthesis protein  31.15 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 326 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  30.38 
 
 		 326 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 326 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  30.53 
 
 		 642 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02810  predicted glycosyltransferase  29.9 
 
 		 323 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0658  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1005  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150967 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_004310  BR0936  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.53 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0930  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.53 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 		 598 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 		 338 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 501 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 348 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 344 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 924 aa  52.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  27.9 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2751  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.83 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.141253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 477 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 328 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2900  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 349 aa  49.7  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  32.52 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  28.81 
 
 		 754 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  21.85 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  22.6 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1005  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4992  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5080  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.566674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5373  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 528 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.6 
 
 		 2401 aa  46.6  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  25.49 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 392 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.06 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 		 359 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  30.17 
 
 		 792 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 426 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3887  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 669 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 		 733 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.16 
 
 		 610 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  30.58 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  27.97 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 489 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 		 905 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1240  hypothetical protein  33.08 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780358 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>