More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3613 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3613  cytochrome P450  100 
 
 		 410 aa  839    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235331  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0729  putative cytochrome P450  80.54 
 
 		 409 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2077  cytochrome P450  89.82 
 
 		 412 aa  729    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3269  cytochrome P450  58.67 
 
 		 410 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1727  cytochrome P450  50 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.263129  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7683  cytochrome P450 hydroxylase  44.47 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.628629  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1225  putative cytochrome P450  38.46 
 
 		 392 aa  277  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0890739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1950  hypothetical protein  36.27 
 
 		 392 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.726447  unclonable  0.000000370327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  33.41 
 
 		 754 aa  240  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0767  cytochrome P450  35.48 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000633357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3025  cytochrome P450  33.25 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  33.16 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  32.25 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  30.77 
 
 		 405 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  30.77 
 
 		 405 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  30.77 
 
 		 405 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  31.97 
 
 		 395 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  31.41 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0246  cytochrome P450  33.94 
 
 		 406 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.463204  normal  0.16972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  31.3 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  32.14 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  31.49 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  31.74 
 
 		 398 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  32.06 
 
 		 408 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  31.08 
 
 		 399 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  32.99 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  32.04 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  32.13 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  31.31 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  30.85 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  31.65 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  31.73 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0425  cytochrome P450  32.9 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314572  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  30.05 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  31.77 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  29.77 
 
 		 427 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  28.74 
 
 		 410 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  31.97 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  28.68 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  30.61 
 
 		 417 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  30.49 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  30.96 
 
 		 401 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  31.06 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3834  cytochrome P450  28.11 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3908  cytochrome P450  28.11 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3820  cytochrome P450  28.11 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.326991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  30.96 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  30.96 
 
 		 401 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  31.63 
 
 		 409 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  33 
 
 		 410 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4221  cytochrome P450  29.6 
 
 		 403 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  32.66 
 
 		 399 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  30.99 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12295  cytochrome P450 128 cyp128  31.75 
 
 		 489 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8218  cytochrome P450 CYP124E1  30.87 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  30.41 
 
 		 396 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  30.98 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  31.19 
 
 		 398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  31.54 
 
 		 402 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  29.74 
 
 		 417 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  30.6 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  27.46 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  29.7 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  29.58 
 
 		 388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  29.8 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6395  cytochrome P450  30.96 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.492605  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  29.92 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  30 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  29.7 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  29.92 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  29.87 
 
 		 394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  30.12 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  30.93 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  29.08 
 
 		 401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  32.65 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  29.78 
 
 		 398 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  29.16 
 
 		 413 aa  162  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  32.29 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  32.2 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  28.97 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5159  cytochrome P450  27.89 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  31.11 
 
 		 436 aa  161  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  31.05 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1008  cytochrome P450 superfamily  26.84 
 
 		 408 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.773004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  30.69 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  31.01 
 
 		 426 aa  160  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  30.34 
 
 		 408 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10781  cytochrome P450 123 cyp123  30.81 
 
 		 402 aa  160  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  31.23 
 
 		 774 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  29.93 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  27.23 
 
 		 380 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4963  cytochrome P450  27.48 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.500706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4580  cytochrome P450  27.48 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  32.28 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4668  cytochrome P450  27.48 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  31.79 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0619  cytochrome P450  32.4 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0610  cytochrome P450  32.4 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537348  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0632  cytochrome P450  32.4 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  29.74 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>