More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2585 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.71 
 
 		 704 aa  784    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  76.1 
 
 		 695 aa  1017    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4137  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  62.72 
 
 		 701 aa  768    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.768208  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  62.61 
 
 		 703 aa  788    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  64.21 
 
 		 661 aa  797    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  64.25 
 
 		 661 aa  798    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  72.45 
 
 		 641 aa  888    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  63.02 
 
 		 702 aa  792    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  67.64 
 
 		 643 aa  825    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  79.97 
 
 		 688 aa  1101    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  55.79 
 
 		 685 aa  688    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  85.73 
 
 		 697 aa  1175    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  53.94 
 
 		 694 aa  654    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  58.51 
 
 		 643 aa  697    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  62.76 
 
 		 703 aa  789    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  62.57 
 
 		 705 aa  791    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 		 701 aa  1414    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  56.06 
 
 		 689 aa  717    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  52.68 
 
 		 711 aa  659    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  83.33 
 
 		 688 aa  1149    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  91.09 
 
 		 697 aa  1254    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  77.89 
 
 		 683 aa  1105    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  60.95 
 
 		 654 aa  751    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  54 
 
 		 706 aa  680    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1298  NADH dehydrogenase subunit L  57.06 
 
 		 681 aa  684    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  64.36 
 
 		 664 aa  802    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  64.06 
 
 		 662 aa  791    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  61.7 
 
 		 663 aa  769    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  65.4 
 
 		 681 aa  837    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  57.33 
 
 		 637 aa  679    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  62.93 
 
 		 666 aa  781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  61.99 
 
 		 666 aa  776    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2233  NADH dehydrogenase subunit L  55.02 
 
 		 703 aa  676    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  66.15 
 
 		 666 aa  832    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  64.84 
 
 		 664 aa  808    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2996  NADH dehydrogenase subunit L  57.01 
 
 		 683 aa  625  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  55.98 
 
 		 646 aa  599  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  54.62 
 
 		 642 aa  586  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  64.02 
 
 		 715 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  50.42 
 
 		 614 aa  570  1e-161  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  51.1 
 
 		 650 aa  567  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  49.36 
 
 		 682 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2527  NADH dehydrogenase subunit L  64.23 
 
 		 720 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1189  NADH dehydrogenase subunit L  64.23 
 
 		 720 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.495317  normal  0.332417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.57 
 
 		 650 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  47.79 
 
 		 686 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.36 
 
 		 666 aa  549  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  48.43 
 
 		 695 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  50.5 
 
 		 669 aa  550  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  47.44 
 
 		 621 aa  550  1e-155  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.02 
 
 		 670 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  48.28 
 
 		 692 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  46.2 
 
 		 686 aa  546  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  47.25 
 
 		 686 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  51.93 
 
 		 657 aa  545  1e-154  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  48.53 
 
 		 621 aa  546  1e-154  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  47.96 
 
 		 682 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.94 
 
 		 675 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  47.55 
 
 		 679 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  47.55 
 
 		 679 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  51.93 
 
 		 657 aa  544  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  47.55 
 
 		 679 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  47.55 
 
 		 679 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  47.55 
 
 		 679 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  47.55 
 
 		 679 aa  544  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.96 
 
 		 671 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.67 
 
 		 678 aa  544  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  47.55 
 
 		 679 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  47.71 
 
 		 695 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.3 
 
 		 675 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  50.34 
 
 		 654 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2155  NADH dehydrogenase subunit L  48.04 
 
 		 684 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.35 
 
 		 678 aa  533  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.34 
 
 		 660 aa  533  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  51.26 
 
 		 653 aa  532  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  48.04 
 
 		 684 aa  534  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  47.83 
 
 		 670 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  47.29 
 
 		 684 aa  531  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  47.89 
 
 		 684 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.86 
 
 		 671 aa  530  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  45.73 
 
 		 692 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  47.89 
 
 		 684 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  47.89 
 
 		 684 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  47.89 
 
 		 684 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.06 
 
 		 679 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.43 
 
 		 676 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1366  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  58.27 
 
 		 712 aa  528  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.699081  normal  0.0261424 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.18 
 
 		 673 aa  524  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.49 
 
 		 674 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.77 
 
 		 672 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  46.64 
 
 		 689 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  46.03 
 
 		 713 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.32 
 
 		 652 aa  512  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.14 
 
 		 686 aa  513  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.6 
 
 		 685 aa  511  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0280  NADH dehydrogenase subunit L  45.88 
 
 		 713 aa  511  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0719  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.39 
 
 		 667 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.23817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.3 
 
 		 642 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0828  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.72 
 
 		 658 aa  503  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  46.09 
 
 		 653 aa  500  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>