36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2151 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  364  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  80.11 
 
 		 186 aa  298  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  62.9 
 
 		 189 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  57.53 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  56.99 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  59.36 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1646  hypothetical protein  60.22 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  35.71 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  42.11 
 
 		 199 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  42.99 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  42.99 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  32.52 
 
 		 223 aa  85.5  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  42.99 
 
 		 248 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  35.25 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  30.28 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  34.43 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  35.25 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  43.04 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  43.04 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  27.57 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  30.97 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  30.16 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2070  hypothetical protein  30.37 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000170748 
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  29.93 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  29.25 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  30.48 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  29.27 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  27.03 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  28.76 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  31.76 
 
 		 315 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  35.8 
 
 		 252 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  0.0200778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3165  hypothetical protein  26.95 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.186856 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1565  hypothetical protein  34.41 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.333128  normal  0.716752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0872  hypothetical protein  35.14 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6079  hypothetical protein  31.52 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>