35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2644 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  100 
 
 		 643 aa  1335    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  63.61 
 
 		 717 aa  846    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  31.9 
 
 		 721 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  30.35 
 
 		 710 aa  269  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  26.14 
 
 		 743 aa  187  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  26.76 
 
 		 757 aa  186  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  23.66 
 
 		 743 aa  183  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  24.26 
 
 		 746 aa  167  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  24.42 
 
 		 803 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  24.73 
 
 		 810 aa  75.5  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  26.68 
 
 		 771 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  26.47 
 
 		 767 aa  72.8  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  26.79 
 
 		 767 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  26.05 
 
 		 818 aa  72.4  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  27.64 
 
 		 753 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  26.39 
 
 		 771 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  31.08 
 
 		 722 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  21.26 
 
 		 792 aa  64.7  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  30.18 
 
 		 776 aa  60.5  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  31.68 
 
 		 792 aa  57  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2640  hypothetical protein  22.22 
 
 		 887 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2596  hypothetical protein  22.22 
 
 		 887 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.889024  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  28 
 
 		 770 aa  51.6  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3054  hypothetical protein  31.43 
 
 		 896 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7392  hypothetical protein  28.06 
 
 		 874 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15610  hypothetical protein  32.38 
 
 		 868 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000202138  unclonable  3.13733e-21 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  33.33 
 
 		 844 aa  48.9  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2005  anticodon nuclease  29.52 
 
 		 392 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2374  anticodon nuclease, putative  29.52 
 
 		 392 aa  48.5  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.815652  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  40.74 
 
 		 895 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4456  hypothetical protein  38.75 
 
 		 833 aa  47.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.681645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4395  hypothetical protein  26.03 
 
 		 410 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.414089  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4940  hypothetical protein  24.01 
 
 		 878 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.188257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06300  hypothetical protein  28.33 
 
 		 854 aa  44.3  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0267  hypothetical protein  33.94 
 
 		 872 aa  43.9  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>