More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1898 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  94.29 
 
 		 420 aa  766    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  828    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  59.36 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  36.67 
 
 		 415 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  40 
 
 		 405 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  39.07 
 
 		 420 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000464132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  38.89 
 
 		 405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 405 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 405 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 414 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 410 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  36.95 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  36.95 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  36.95 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  36.95 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  36.95 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  36.95 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 431 aa  202  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  36.95 
 
 		 430 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  37.6 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000499606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 407 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 407 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  38.4 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  32.64 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  32.79 
 
 		 423 aa  146  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  30.83 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 412 aa  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 416 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  32.08 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 411 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 434 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 417 aa  126  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 415 aa  117  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 418 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 446 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  27.52 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  26.33 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  28.47 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  28.14 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 434 aa  103  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  26.05 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 417 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 437 aa  99.4  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 395 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 428 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  26.93 
 
 		 437 aa  97.1  6e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  26.93 
 
 		 437 aa  96.7  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  26.34 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  26.09 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  23.11 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  23.11 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  26.02 
 
 		 432 aa  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  23.97 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  24.8 
 
 		 431 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  26.02 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 441 aa  89.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  30.74 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 407 aa  87.4  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  27.65 
 
 		 407 aa  86.7  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 421 aa  86.3  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  25.67 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  34.42 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  34.42 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1034  hypothetical protein  23 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  21.84 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  21.84 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  24.93 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  27 
 
 		 450 aa  80.1  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  24.66 
 
 		 427 aa  79.7  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  20.92 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  20.66 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>