More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1169 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1169  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 400 aa  810    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178123 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1236  acetyl-CoA acetyltransferase  95.75 
 
 		 400 aa  785    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.439957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1553  acetyl-CoA acetyltransferase  60.75 
 
 		 400 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  61 
 
 		 401 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 412 aa  427  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  52.75 
 
 		 401 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.87 
 
 		 401 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.98 
 
 		 401 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  52.12 
 
 		 398 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.23 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  52.26 
 
 		 403 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  52.12 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.49 
 
 		 406 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.75 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  51.37 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.99 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.25 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.75 
 
 		 401 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.99 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.63 
 
 		 406 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.61 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.38 
 
 		 405 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.75 
 
 		 401 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.75 
 
 		 401 aa  411  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.75 
 
 		 401 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.87 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.11 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.25 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.74 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.12 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  49.75 
 
 		 399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.49 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.24 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.62 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  49.63 
 
 		 404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.37 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  52.5 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.49 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.49 
 
 		 402 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.37 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3081  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.24 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.426252 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  50.62 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51 
 
 		 401 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.62 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.99 
 
 		 401 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.24 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.38 
 
 		 401 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 405 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.75 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.25 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.75 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.25 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.25 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.86 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.13 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.75 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 401 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2833  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.12 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.63 
 
 		 403 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.5 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.75 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1831  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 403 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.76791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  49.25 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.75 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.25 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.5 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.5 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.76 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.13 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0375  thiolase  50.25 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000288796  hitchhiker  0.0000265962 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.75 
 
 		 400 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  49.63 
 
 		 400 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.75 
 
 		 400 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2398  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.62 
 
 		 404 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.87 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.12 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1198  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.63 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.51 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.01 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>