More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1146 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  100 
 
 		 283 aa  589  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  65.49 
 
 		 280 aa  378  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  64.62 
 
 		 280 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  62.07 
 
 		 286 aa  325  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.56 
 
 		 293 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  57.25 
 
 		 298 aa  322  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  58.08 
 
 		 286 aa  319  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  59.62 
 
 		 291 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  57.36 
 
 		 283 aa  314  8e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  57.85 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.53 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  59.07 
 
 		 290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  58.3 
 
 		 285 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  55.76 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  56.59 
 
 		 282 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  55.76 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.46 
 
 		 279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  56.13 
 
 		 292 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  58.75 
 
 		 285 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  56.92 
 
 		 293 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  58.75 
 
 		 289 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  58.14 
 
 		 286 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  57.63 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  59.14 
 
 		 292 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  56.81 
 
 		 304 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  57.25 
 
 		 291 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  57.36 
 
 		 285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  57.2 
 
 		 279 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  58.37 
 
 		 291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  57.2 
 
 		 279 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  57.92 
 
 		 289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  58.2 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.11 
 
 		 291 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  56.81 
 
 		 279 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  56.15 
 
 		 280 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  57.36 
 
 		 292 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  55.68 
 
 		 279 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  57.75 
 
 		 285 aa  301  9e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.37 
 
 		 286 aa  299  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.94 
 
 		 294 aa  299  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  56.03 
 
 		 290 aa  298  6e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  55.38 
 
 		 280 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  55.94 
 
 		 288 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  55.38 
 
 		 280 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  55.94 
 
 		 288 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  54.09 
 
 		 290 aa  295  4e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  55.64 
 
 		 290 aa  295  6e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  57.2 
 
 		 291 aa  295  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  55.34 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  55.94 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  55 
 
 		 279 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  54.86 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  55.25 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  55.56 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  56.42 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  54.86 
 
 		 288 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  54.86 
 
 		 288 aa  292  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  54.86 
 
 		 288 aa  292  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  54.86 
 
 		 288 aa  292  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  54.86 
 
 		 288 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  54.86 
 
 		 288 aa  292  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  54.86 
 
 		 288 aa  292  4e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  55.56 
 
 		 288 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  55.68 
 
 		 293 aa  291  8e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  56.03 
 
 		 290 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.98 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  58.08 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  53.46 
 
 		 291 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  54.17 
 
 		 290 aa  289  4e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  56.93 
 
 		 262 aa  288  5.0000000000000004e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  57.69 
 
 		 284 aa  288  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  57.69 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.25 
 
 		 289 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  56.92 
 
 		 289 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  50.38 
 
 		 288 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.44 
 
 		 230 aa  165  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  41.89 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.78 
 
 		 233 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  39.29 
 
 		 234 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  38.26 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  42.67 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0798  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.91 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.808485  normal  0.965794 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  41.78 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.09 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.09 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2848  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.21 
 
 		 233 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0336918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.36 
 
 		 232 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  40.89 
 
 		 230 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  40.53 
 
 		 234 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.53 
 
 		 234 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  40.09 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.21 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  40.09 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  39.38 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.09 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  40.09 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  39.91 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2123  putative glutathione S-transferase  40.79 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0251  putative glutathione S-transferase  40.79 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1591  putative glutathione S-transferase  40.79 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>