More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0758 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4676  putative sulfite oxidase subunit YedY  91.1 
 
 
341 aa  634    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107716  hitchhiker  0.00951249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0758  putative sulfite oxidase subunit YedY  100 
 
 
337 aa  694    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000256517  hitchhiker  0.0000149537 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4540  putative sulfite oxidase subunit YedY  91.1 
 
 
337 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000750768  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4674  putative sulfite oxidase subunit YedY  89.61 
 
 
337 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000277637  hitchhiker  0.00000119887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4784  putative sulfite oxidase subunit YedY  82.49 
 
 
337 aa  597  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148437  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0985  hypothetical protein  81.01 
 
 
337 aa  584  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00832393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0850  putative sulfite oxidase subunit YedY  81.01 
 
 
337 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0251202  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5406  putative sulfite oxidase subunit YedY  77.45 
 
 
337 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62110  putative sulfite oxidase subunit YedY  77.74 
 
 
337 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1011  putative sulfite oxidase subunit YedY  74.18 
 
 
336 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  hitchhiker  0.000046829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07350  putative sulfite oxidase subunit YedY  73.89 
 
 
336 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.19996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0886  putative sulfite oxidase subunit YedY  60.24 
 
 
324 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00104567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1330  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.86 
 
 
330 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000518918  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0063  putative sulfite oxidase subunit YedY  57.1 
 
 
298 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0824415  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1503  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.29 
 
 
316 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1360  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.42 
 
 
315 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0715758  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0593  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.18 
 
 
302 aa  360  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.82 
 
 
313 aa  357  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2485  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.69 
 
 
317 aa  357  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.39 
 
 
331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0395  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.46 
 
 
366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3838  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.03 
 
 
333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00559103  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0462  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.46 
 
 
366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512392  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2914  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.23 
 
 
335 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.618004  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0247  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.79 
 
 
333 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15698  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.12 
 
 
315 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1201  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.16 
 
 
366 aa  354  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.229043  normal  0.403829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0349  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.5 
 
 
331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0106094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  56.88 
 
 
315 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0302  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.86 
 
 
344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0311  putative sulfite oxidase subunit YedY  50.86 
 
 
331 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810304  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2804  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.98 
 
 
331 aa  352  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321388  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3608  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.6 
 
 
331 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0264425  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0383  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.94 
 
 
331 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3977  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.52 
 
 
313 aa  351  8.999999999999999e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.710612  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.1 
 
 
331 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4414  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.01 
 
 
333 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0244066  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2724  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.64 
 
 
331 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0990  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.49 
 
 
319 aa  350  3e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3482  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.8 
 
 
331 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.49 
 
 
319 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0362  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.64 
 
 
331 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.24616  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0844  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.25 
 
 
310 aa  349  5e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.612876  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3033  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.5 
 
 
331 aa  347  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2014  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.53 
 
 
332 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4120  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.63 
 
 
313 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0279916  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2619  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.8 
 
 
338 aa  345  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0854128  normal  0.179498 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.8 
 
 
331 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.8 
 
 
331 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.8 
 
 
331 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.8 
 
 
331 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.8 
 
 
331 aa  345  6e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2750  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.88 
 
 
334 aa  345  7e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000229765  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2072  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.71 
 
 
334 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.41751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2202  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.71 
 
 
334 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000714656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01886  hypothetical protein  54.71 
 
 
334 aa  344  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000117188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01876  hypothetical protein  54.71 
 
 
334 aa  344  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000821276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1674  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.71 
 
 
334 aa  344  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00322488  normal  0.215149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3737  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.18 
 
 
334 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  0.0204641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0912  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.71 
 
 
334 aa  344  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000237537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1214  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.71 
 
 
334 aa  344  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000894438  normal  0.649922 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4088  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.33 
 
 
313 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.89 
 
 
331 aa  343  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3640  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.18 
 
 
334 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  hitchhiker  0.000496426 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0538  oxidoreductase molybdopterin binding protein  64.2 
 
 
315 aa  343  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3675  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.18 
 
 
334 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0647126  normal  0.489877 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3569  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.88 
 
 
334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0584327  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0877  putative sulfite oxidase subunit YedY  65.23 
 
 
322 aa  343  2.9999999999999997e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.687916  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3568  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.88 
 
 
334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00040411  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1134  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.49 
 
 
336 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.843909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3877  putative sulfite oxidase subunit YedY  66.02 
 
 
306 aa  342  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1680  oxidoreductase molybdopterin binding protein  54.57 
 
 
334 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2855  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.87 
 
 
315 aa  342  5.999999999999999e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0576  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.87 
 
 
341 aa  342  8e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3690  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.13 
 
 
333 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.20174  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.15 
 
 
331 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.29 
 
 
322 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3633  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.17 
 
 
338 aa  338  7e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  61.15 
 
 
331 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0368  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.6 
 
 
320 aa  338  8e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.55 
 
 
331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3992  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.24 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0257  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.49 
 
 
333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1505  putative sulfite oxidase subunit YedY  55.39 
 
 
319 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122677  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0371  putative sulfite oxidase subunit YedY  50 
 
 
320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.789292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1368  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.96 
 
 
319 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3259  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.03 
 
 
331 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.439006  normal  0.753503 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2817  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.47 
 
 
301 aa  335  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  normal  0.368407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2134  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.85 
 
 
302 aa  335  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1410  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.01 
 
 
301 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1683  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.75 
 
 
323 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.534217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0077  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.01 
 
 
301 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0667  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.24 
 
 
332 aa  333  2e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975982 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0396  putative sulfite oxidase subunit YedY  54.91 
 
 
334 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0701644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0623  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.84 
 
 
305 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  51.86 
 
 
336 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1462  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.52 
 
 
328 aa  333  3e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00391341  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2234  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.44 
 
 
344 aa  332  6e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0607971  normal  0.313251 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2912  putative sulfite oxidase subunit YedY  53.03 
 
 
331 aa  331  9e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  52.44 
 
 
334 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>