210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0233 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  85.45 
 
 		 434 aa  758    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  87.97 
 
 		 433 aa  764    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  100 
 
 		 435 aa  868    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  26.92 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  27.01 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  27.45 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  26.24 
 
 		 446 aa  113  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  27.75 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  25.54 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.06 
 
 		 412 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  25.16 
 
 		 428 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  25.67 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.11 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  26.26 
 
 		 432 aa  86.7  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  21.82 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  25.9 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  23.19 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  26 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  25 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  27.48 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  25.37 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  24.05 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  22.25 
 
 		 403 aa  79.7  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  25.19 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  24.04 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  25.32 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  26.06 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  23.03 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  23.95 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  23.21 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  25.42 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  23.38 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  23.38 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  23.3 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  23.86 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  23.28 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  23.04 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  25.47 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  25.14 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1353  natural resistance-associated macrophage protein  26.32 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.573768  normal  0.0815096 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  25.14 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  25.14 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  24.56 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  23.29 
 
 		 406 aa  67  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  24.22 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  23.03 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  24.85 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  23.03 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  23.92 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  22.15 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  22.63 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  23.37 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  24.17 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  22.7 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  25.25 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4171  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.3 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  24.22 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  22.4 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  26.2 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0654  manganese transport protein MntH  26.15 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0327142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3643  natural resistance-associated macrophage protein  22.62 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.145249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  22.37 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  23.32 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2183  manganese transporter NRAMP  24.42 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0049052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  22.49 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  22.49 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  22.49 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  22.49 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  22.49 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4366  manganese transporter NRAMP  24.62 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4453  Mn2+/Fe2+ transporter  24.62 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.0620923 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2933  natural resistance-associated macrophage protein  23.1 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4747  Mn2+/Fe2+ transporter  24.62 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0999  NRAMP family Mn2+ and Fe2+ transporter  23.61 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.83 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.62 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  25.23 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  25.99 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0224  natural resistance-associated macrophage protein  27.93 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0449  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.24 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  23.5 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  24.19 
 
 		 445 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  21.28 
 
 		 450 aa  57  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  21.28 
 
 		 450 aa  57  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.04 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  23.12 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  23.48 
 
 		 431 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  24.61 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3070  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.16 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  22.49 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  23.84 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  25.23 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.43 
 
 		 625 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  21.86 
 
 		 426 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0222  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.3 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  24.05 
 
 		 456 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  21.57 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  26.08 
 
 		 544 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  24.57 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  22.71 
 
 		 429 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>