More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3660 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
202 aa  417  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  43.82 
 
 
184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  43.82 
 
 
184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  40.21 
 
 
201 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  41.01 
 
 
183 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  47.19 
 
 
219 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  42.13 
 
 
199 aa  157  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  44.39 
 
 
224 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  44.39 
 
 
190 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  44.39 
 
 
190 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  44.39 
 
 
190 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  40.11 
 
 
181 aa  155  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  46.33 
 
 
209 aa  154  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  42.78 
 
 
191 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  39.55 
 
 
183 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  39.55 
 
 
183 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  40.74 
 
 
228 aa  150  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  42.22 
 
 
182 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  40.93 
 
 
201 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  41.38 
 
 
189 aa  147  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  42.46 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  43.24 
 
 
194 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  41.49 
 
 
189 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  43.58 
 
 
180 aa  145  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  40.93 
 
 
199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  43.39 
 
 
197 aa  144  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  43.82 
 
 
193 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  44.94 
 
 
184 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  42.33 
 
 
198 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  42.86 
 
 
188 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  42.7 
 
 
187 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  41.11 
 
 
201 aa  142  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  44 
 
 
188 aa  142  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  43.41 
 
 
309 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  42.7 
 
 
190 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  43.26 
 
 
188 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  48.39 
 
 
185 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  48.73 
 
 
191 aa  141  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  44.94 
 
 
184 aa  141  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  48.73 
 
 
191 aa  141  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  45.45 
 
 
197 aa  141  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.2 
 
 
218 aa  141  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 
185 aa  141  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  45.71 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  43.02 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  42.93 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  43.17 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  44 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  49.33 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  43.17 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  41.95 
 
 
187 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  42.94 
 
 
189 aa  138  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  42.62 
 
 
193 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  41.95 
 
 
186 aa  137  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5332  Resolvase domain protein  44.94 
 
 
184 aa  137  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 
195 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  42.08 
 
 
193 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  49.02 
 
 
201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 
193 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  42.86 
 
 
185 aa  134  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  45.71 
 
 
209 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  42.29 
 
 
188 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  42.13 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  47.1 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  42.78 
 
 
188 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  39.23 
 
 
196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 
208 aa  131  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  44.26 
 
 
190 aa  132  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  40.33 
 
 
192 aa  131  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  44.79 
 
 
176 aa  131  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  41.3 
 
 
201 aa  131  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  44 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  40.11 
 
 
201 aa  131  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 
185 aa  131  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  37.77 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  48.92 
 
 
307 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  48.92 
 
 
307 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  38.3 
 
 
190 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  42.67 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  43.57 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 
198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  42 
 
 
196 aa  128  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  42 
 
 
206 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  42 
 
 
206 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  43.98 
 
 
189 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  40.68 
 
 
184 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  37.84 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  41.08 
 
 
194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  41.08 
 
 
194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  44.97 
 
 
324 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 
194 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  39.33 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  39.33 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 
197 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 
197 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  37.69 
 
 
203 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  45.99 
 
 
186 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  44.53 
 
 
184 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  39.79 
 
 
194 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  40.68 
 
 
189 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>