More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3110 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
283 aa  579  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0903  acetoin reductase, putative  63.02 
 
 
269 aa  331  7.000000000000001e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  54.51 
 
 
261 aa  308  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32140  acetoin reductase family protein  51.91 
 
 
262 aa  253  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.206629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1091  acetoin reductase  49.06 
 
 
268 aa  242  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  47.91 
 
 
259 aa  238  8e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0093  glucose/ribitol dehydrogenase  49.43 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2541  acetoin reductases  47.73 
 
 
259 aa  232  6e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0776085  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0974  acetoin reductase  49.62 
 
 
257 aa  229  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0303  acetoin reductase  46.92 
 
 
257 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0296  acetoin reductase  47.69 
 
 
257 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0838  acetoin reductase  45.25 
 
 
259 aa  222  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.387931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0358  acetoin reductase  46.77 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.110663  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.42 
 
 
260 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
260 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  46.92 
 
 
256 aa  218  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  46.77 
 
 
264 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0077  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  43.68 
 
 
260 aa  216  4e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.840544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  47.15 
 
 
264 aa  216  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0990  acetoin reductase  46.15 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2379  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.31 
 
 
257 aa  205  7e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.303229  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.64 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138148 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1148  Short-chain alcohol dehydrogenase  46.3 
 
 
253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.59 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4158  acetoin reductase  46.39 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436018  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05373  conserved hypothetical protein  43.8 
 
 
274 aa  192  5e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00512798  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2396  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  40.37 
 
 
266 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.084933  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  44.27 
 
 
258 aa  190  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.83 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.06 
 
 
247 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 
248 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0698  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  40.46 
 
 
259 aa  182  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00117968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  40.07 
 
 
265 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.38 
 
 
247 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.3 
 
 
246 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0618  acetoin reductases  44.66 
 
 
270 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.54 
 
 
246 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
261 aa  178  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0184559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
261 aa  178  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0638  acetoin reductases  44.66 
 
 
285 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.140938  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0625  alcohol dehydrogenase family protein  44.66 
 
 
285 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0750479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
246 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.64 
 
 
246 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
245 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.64 
 
 
245 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
260 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.55 
 
 
247 aa  175  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40 
 
 
247 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
267 aa  175  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.649752  normal  0.721857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.63 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.1 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.98 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.6 
 
 
246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2514  sorbitol dehydrogenase  37.36 
 
 
258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.449953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0298  sorbitol dehydrogenase  36.06 
 
 
262 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.514875  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.55 
 
 
245 aa  172  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.68 
 
 
246 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
257 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1602  acetoin reductase  43.8 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2503  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
246 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000353478  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0145  acetoin reductase  38.4 
 
 
258 aa  172  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000146421  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  37.74 
 
 
250 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0699  sorbitol dehydrogenase  37.36 
 
 
258 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.504553 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2257  acetoin reductase  40.08 
 
 
262 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2622  sorbitol dehydrogenase  36.98 
 
 
258 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  36.23 
 
 
260 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
262 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2646  sorbitol dehydrogenase  36.6 
 
 
258 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
256 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5929  sorbitol dehydrogenase  36.6 
 
 
258 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
246 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
267 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00668393  normal  0.136098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1988  sorbitol dehydrogenase  36.33 
 
 
276 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.921173  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2598  sorbitol dehydrogenase  36.33 
 
 
276 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.98 
 
 
250 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.79 
 
 
245 aa  168  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 
249 aa  168  8e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.7 
 
 
246 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.95 
 
 
249 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.02 
 
 
246 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
253 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.02 
 
 
246 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  36.4 
 
 
247 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2335  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.69 
 
 
253 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.46 
 
 
244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  38.91 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.61 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  40.47 
 
 
253 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>