45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2887 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 150 aa  309  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  57.55 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  59.59 
 
 		 148 aa  163  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  57.97 
 
 		 146 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  40.88 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  34.23 
 
 		 157 aa  90.1  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  35.43 
 
 		 182 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  36.88 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0831  C_GCAxxG_C_C family protein  38.58 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000034756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1302  C_GCAxxG_C_C family protein  31.62 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0554  C_GCAxxG_C_C family protein  35.43 
 
 		 183 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.231006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  38.26 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  35.85 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  29.5 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0395  hypothetical protein  39.36 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  37.5 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  39.8 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  37.1 
 
 		 257 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  31.25 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3850  C_GCAxxG_C_C family protein  39.8 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  31.2 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  31.2 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  29.41 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  30.28 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  33.06 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  35.51 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  33.86 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  30.84 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  33.96 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  28.89 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2625  C_GCAxxG_C_C family protein  37.7 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  30.84 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3274  C_GCAxxG_C_C family protein  23.96 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  28.97 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  28.97 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  26.52 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  32.14 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  30.99 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3934  C_GCAxxG_C_C family protein  31.67 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0137469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  29 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1057  C_GCAxxG_C_C family protein  35.09 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0287479 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0638  hypothetical protein  36.05 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0869732 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  27.54 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  31.58 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01840  C_GCAxxG_C_C family probable redox protein  38.32 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>