More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2398 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  253  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  68.6 
 
 		 125 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  65.85 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  63.64 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  59.35 
 
 		 124 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  63.11 
 
 		 126 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  60.48 
 
 		 128 aa  152  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  59.02 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 126 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  63.11 
 
 		 128 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  58.87 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  59.02 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  63.71 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  57.02 
 
 		 125 aa  147  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  58.33 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  54.84 
 
 		 126 aa  146  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 124 aa  146  9e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 127 aa  145  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  57.38 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1495  endoribonuclease L-PSP  57.5 
 
 		 133 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 125 aa  140  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  57.02 
 
 		 127 aa  140  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 124 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 124 aa  139  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  54.92 
 
 		 124 aa  139  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  54.92 
 
 		 124 aa  139  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 124 aa  139  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 126 aa  139  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 124 aa  139  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 128 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  54.92 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 125 aa  137  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  55.37 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  53.28 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  56.3 
 
 		 136 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  57.5 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 129 aa  133  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0263  YjgF-like protein  54.7 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.668867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 		 126 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  49.17 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  49.59 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 126 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  54.1 
 
 		 125 aa  130  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 125 aa  130  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  52.07 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  54.47 
 
 		 124 aa  130  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  53.33 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  50.83 
 
 		 126 aa  130  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  53.28 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 129 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  49.59 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  50.83 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  50.41 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  54.33 
 
 		 132 aa  127  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1306  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.566325  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  55.28 
 
 		 126 aa  127  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  53.78 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  46.72 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  48.72 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  50.83 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  50.43 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11098  putative translation initiation inhibitor  52.07 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>