48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2169 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  734    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0719  hypothetical protein  32.54 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00617075  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  26.49 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  26.09 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  25.64 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  26.42 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  25.69 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  26.28 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  26.06 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.76 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  29.94 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  28.23 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  24.12 
 
 		 344 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  24.84 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  25.62 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  23.86 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25.95 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  21.9 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  23.32 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  24.65 
 
 		 353 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  22.9 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  23.23 
 
 		 347 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  23.21 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  23.51 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  25.35 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  24.53 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  24.27 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  33.96 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  26.04 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  19.41 
 
 		 344 aa  53.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  21.78 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  22.33 
 
 		 357 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  22.29 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  22.73 
 
 		 357 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  25.51 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  25 
 
 		 366 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  20.97 
 
 		 380 aa  49.3  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  22.75 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  20.67 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  27.32 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  21.62 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  23.79 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  24.11 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  28.32 
 
 		 335 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3442  hypothetical protein  23.9 
 
 		 338 aa  46.6  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  20.54 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  28.5 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  22.41 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>